Protein–RNA interactions for Protein: Q12460

NOP56, Nucleolar protein 56, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NOP56Q12460 YPS3YLR121C 1527 nt8.09□□□□□ -1.11 RIP-Chip
NOP56Q12460 MSC1YML128C 1542 nt8.09□□□□□ -1.11
NOP56Q12460 CBK1YNL161W 2271 nt8.09□□□□□ -1.11
NOP56Q12460 YER188WYER188W 720 nt8.09□□□□□ -1.11
NOP56Q12460 NUC1YJL208C 990 nt8.09□□□□□ -1.11
NOP56Q12460 PAU21YOR394W 495 nt8.09□□□□□ -1.11
NOP56Q12460 PAU22YPL282C 495 nt8.09□□□□□ -1.11
NOP56Q12460 DLD2YDL178W 1593 nt8.09□□□□□ -1.11
NOP56Q12460 BNI5YNL166C 1347 nt8.08□□□□□ -1.12
NOP56Q12460 PRY1YJL079C 900 nt8.08□□□□□ -1.12 RIP-Chip
NOP56Q12460 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt8.07□□□□□ -1.12
NOP56Q12460 SMM1YNR015W 1155 nt8.07□□□□□ -1.12
NOP56Q12460 MDH2YOL126C 1134 nt8.07□□□□□ -1.12
NOP56Q12460 MLS1YNL117W 1665 nt8.06□□□□□ -1.12
NOP56Q12460 URH1YDR400W 1023 nt8.06□□□□□ -1.12
NOP56Q12460 LOT5YKL183W 921 nt8.06□□□□□ -1.12
NOP56Q12460 CRN1YLR429W 1956 nt8.06□□□□□ -1.12
NOP56Q12460 CSM1YCR086W 573 nt8.04□□□□□ -1.12
NOP56Q12460 FUB1YCR076C 753 nt8.03□□□□□ -1.12
NOP56Q12460 RBG2YGR173W 1107 nt8.03□□□□□ -1.12
NOP56Q12460 RIM2YBR192W 1134 nt8.03□□□□□ -1.12
NOP56Q12460 OSH7YHR001W 1314 nt8.03□□□□□ -1.12
NOP56Q12460 EDC3YEL015W 1656 nt8.02□□□□□ -1.13
NOP56Q12460 LCP5YER127W 1074 nt8.02□□□□□ -1.13
NOP56Q12460 ARO7YPR060C 771 nt8.02□□□□□ -1.13
NOP56Q12460 DIA4YHR011W 1341 nt8.02□□□□□ -1.13
NOP56Q12460 LSB3YFR024C-A 1380 nt8.01□□□□□ -1.13
NOP56Q12460 CAB5YDR196C 726 nt8.01□□□□□ -1.13
NOP56Q12460 SAM50YNL026W 1455 nt8□□□□□ -1.13
NOP56Q12460 YPI1YFR003C 468 nt8□□□□□ -1.13
NOP56Q12460 YJL118WYJL118W 660 nt8□□□□□ -1.13
NOP56Q12460 RAS2YNL098C 969 nt8□□□□□ -1.13
NOP56Q12460 RPC31YNL151C 756 nt8□□□□□ -1.13
NOP56Q12460 RPT5YOR117W 1305 nt8□□□□□ -1.13
NOP56Q12460 DLD3YEL071W 1491 nt8□□□□□ -1.13
NOP56Q12460 TOS2YGR221C 1869 nt7.99□□□□□ -1.13
NOP56Q12460 ENT4YLL038C 744 nt7.99□□□□□ -1.13 RIP-Chip
NOP56Q12460 YLR046CYLR046C 813 nt7.99□□□□□ -1.13
NOP56Q12460 YBL111CYBL111C 2004 nt7.99□□□□□ -1.13
NOP56Q12460 HSM3YBR272C 1443 nt7.99□□□□□ -1.13
NOP56Q12460 YLR072WYLR072W 2082 nt7.99□□□□□ -1.13
NOP56Q12460 PUS5YLR165C 765 nt7.98□□□□□ -1.13
NOP56Q12460 HEM13YDR044W 987 nt7.97□□□□□ -1.13
NOP56Q12460 AAC3YBR085W 924 nt7.97□□□□□ -1.13
NOP56Q12460 POB3YML069W 1659 nt7.97□□□□□ -1.13
NOP56Q12460 ICL2YPR006C 1728 nt7.96□□□□□ -1.14
NOP56Q12460 VRG4YGL225W 1014 nt7.96□□□□□ -1.14
NOP56Q12460 ADE17YMR120C 1779 nt7.95□□□□□ -1.14
NOP56Q12460 AGP2YBR132C 1791 nt7.95□□□□□ -1.14
NOP56Q12460 VMA11YPL234C 495 nt7.95□□□□□ -1.14
NOP56Q12460 RIB7YBR153W 735 nt7.95□□□□□ -1.14
NOP56Q12460 PRP2YNR011C 2631 nt7.94□□□□□ -1.14
NOP56Q12460 ATG22YCL038C 1587 nt7.94□□□□□ -1.14
NOP56Q12460 FHN1YGR131W 525 nt7.94□□□□□ -1.14
NOP56Q12460 OYE2YHR179W 1203 nt7.94□□□□□ -1.14
NOP56Q12460 AI5_BETAQ0075 1065 nt7.93□□□□□ -1.14
NOP56Q12460 MGM101YJR144W 810 nt7.93□□□□□ -1.14
NOP56Q12460 APT1YML022W 564 nt7.93□□□□□ -1.14
NOP56Q12460 GPN2YOR262W 1044 nt7.93□□□□□ -1.14
NOP56Q12460 YPL264CYPL264C 1062 nt7.93□□□□□ -1.14
NOP56Q12460 ACO1YLR304C 2337 nt7.93□□□□□ -1.14
NOP56Q12460 LEU4YNL104C 1860 nt7.92□□□□□ -1.14
NOP56Q12460 ASP3-1YLR155C 1089 nt7.92□□□□□ -1.14
NOP56Q12460 ASP3-2YLR157C 1089 nt7.92□□□□□ -1.14
NOP56Q12460 ASP3-3YLR158C 1089 nt7.92□□□□□ -1.14
NOP56Q12460 ASP3-4YLR160C 1089 nt7.92□□□□□ -1.14
NOP56Q12460 KDX1YKL161C 1302 nt7.92□□□□□ -1.14
NOP56Q12460 VTS1YOR359W 1572 nt7.92□□□□□ -1.14
NOP56Q12460 HXT11YOL156W 1704 nt7.92□□□□□ -1.14
NOP56Q12460 SOL2YCR073W-A 948 nt7.91□□□□□ -1.14
NOP56Q12460 SAM3YPL274W 1764 nt7.91□□□□□ -1.14
NOP56Q12460 PMT7YDR307W 1989 nt7.91□□□□□ -1.14
NOP56Q12460 TRR1YDR353W 960 nt7.9□□□□□ -1.14
NOP56Q12460 IDP3YNL009W 1263 nt7.9□□□□□ -1.14
NOP56Q12460 TIP1YBR067C 633 nt7.9□□□□□ -1.14
NOP56Q12460 EAF3YPR023C 1206 nt7.9□□□□□ -1.14
NOP56Q12460 NMD5YJR132W 3147 nt7.9□□□□□ -1.14
NOP56Q12460 YOS9YDR057W 1629 nt7.89□□□□□ -1.15
NOP56Q12460 YIP4YGL198W 708 nt7.89□□□□□ -1.15
NOP56Q12460 YJL055WYJL055W 738 nt7.89□□□□□ -1.15
NOP56Q12460 AIM1YAL046C 357 nt7.89□□□□□ -1.15
NOP56Q12460 RMA1YKL132C 1293 nt7.89□□□□□ -1.15
NOP56Q12460 ASN2YGR124W 1719 nt7.89□□□□□ -1.15
NOP56Q12460 NDE2YDL085W 1638 nt7.89□□□□□ -1.15
NOP56Q12460 NPP2YEL016C 1482 nt7.88□□□□□ -1.15
NOP56Q12460 YHR131CYHR131C 2553 nt7.88□□□□□ -1.15
NOP56Q12460 DPL1YDR294C 1770 nt7.88□□□□□ -1.15
NOP56Q12460 TRP2YER090W 1524 nt7.87□□□□□ -1.15
NOP56Q12460 TPS1YBR126C 1488 nt7.87□□□□□ -1.15
NOP56Q12460 RIB2YOL066C 1776 nt7.86□□□□□ -1.15
NOP56Q12460 SGE1YPR198W 1632 nt7.85□□□□□ -1.15
NOP56Q12460 YDR467CYDR467C 327 nt7.85□□□□□ -1.15
NOP56Q12460 YNR029CYNR029C 1290 nt7.85□□□□□ -1.15
NOP56Q12460 SNX3YOR357C 489 nt7.85□□□□□ -1.15
NOP56Q12460 GAL3YDR009W 1563 nt7.84□□□□□ -1.15
NOP56Q12460 TAT2YOL020W 1779 nt7.84□□□□□ -1.15
NOP56Q12460 ERG12YMR208W 1332 nt7.83□□□□□ -1.16
NOP56Q12460 DAL7YIR031C 1665 nt7.83□□□□□ -1.16
NOP56Q12460 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.83□□□□□ -1.16
NOP56Q12460 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.83□□□□□ -1.16
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