Protein–RNA interactions for Protein: Q12116

TMS1, Membrane protein TMS1, yeastyeast

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TMS1Q12116 SER2YGR208W 930 nt7.78□□□□□ -1.16
TMS1Q12116 HRA1HRA1 564 nt7.78□□□□□ -1.16
TMS1Q12116 VMA11YPL234C 495 nt7.78□□□□□ -1.16
TMS1Q12116 RIM2YBR192W 1134 nt7.78□□□□□ -1.16
TMS1Q12116 PCP1YGR101W 1041 nt7.77□□□□□ -1.17
TMS1Q12116 FRA1YLL029W 2250 nt7.77□□□□□ -1.17
TMS1Q12116 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt7.76□□□□□ -1.17
TMS1Q12116 CYC3YAL039C 810 nt7.76□□□□□ -1.17
TMS1Q12116 RPC31YNL151C 756 nt7.76□□□□□ -1.17
TMS1Q12116 SPE2YOL052C 1191 nt7.76□□□□□ -1.17
TMS1Q12116 ABZ2YMR289W 1125 nt7.75□□□□□ -1.17
TMS1Q12116 SAC7YDR389W 1965 nt7.75□□□□□ -1.17
TMS1Q12116 HTS1YPR033C 1641 nt7.74□□□□□ -1.17
TMS1Q12116 MFG1YDL233W 1377 nt7.74□□□□□ -1.17
TMS1Q12116 FSH2YMR222C 672 nt7.74□□□□□ -1.17
TMS1Q12116 ADH3YMR083W 1128 nt7.73□□□□□ -1.17
TMS1Q12116 RRT8YOL048C 1029 nt7.73□□□□□ -1.17
TMS1Q12116 YOR072WYOR072W 315 nt7.73□□□□□ -1.17
TMS1Q12116 TOS1YBR162C 1368 nt7.72□□□□□ -1.17
TMS1Q12116 GRH1YDR517W 1119 nt7.72□□□□□ -1.17
TMS1Q12116 PHB2YGR231C 933 nt7.72□□□□□ -1.17
TMS1Q12116 MOB1YIL106W 945 nt7.72□□□□□ -1.17
TMS1Q12116 ERG13YML126C 1476 nt7.72□□□□□ -1.17
TMS1Q12116 MAS1YLR163C 1389 nt7.71□□□□□ -1.17
TMS1Q12116 YRF1-2YER190W 5046 nt7.71□□□□□ -1.17
TMS1Q12116 LEU4YNL104C 1860 nt7.71□□□□□ -1.18
TMS1Q12116 ADE8YDR408C 645 nt7.71□□□□□ -1.18
TMS1Q12116 SNX3YOR357C 489 nt7.71□□□□□ -1.18
TMS1Q12116 FET5YFL041W 1869 nt7.7□□□□□ -1.18
TMS1Q12116 TVP23YDR084C 600 nt7.7□□□□□ -1.18
TMS1Q12116 KRR1YCL059C 951 nt7.69□□□□□ -1.18
TMS1Q12116 MEX67YPL169C 1800 nt7.67□□□□□ -1.18
TMS1Q12116 INH1YDL181W 258 nt7.66□□□□□ -1.18
TMS1Q12116 HOG1YLR113W 1308 nt7.66□□□□□ -1.18
TMS1Q12116 NPP2YEL016C 1482 nt7.64□□□□□ -1.19
TMS1Q12116 ENO2YHR174W 1314 nt7.64□□□□□ -1.19
TMS1Q12116 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt7.64□□□□□ -1.19
TMS1Q12116 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt7.64□□□□□ -1.19
TMS1Q12116 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt7.64□□□□□ -1.19
TMS1Q12116 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt7.64□□□□□ -1.19
TMS1Q12116 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt7.64□□□□□ -1.19
TMS1Q12116 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt7.64□□□□□ -1.19
TMS1Q12116 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt7.64□□□□□ -1.19
TMS1Q12116 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt7.64□□□□□ -1.19
TMS1Q12116 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt7.64□□□□□ -1.19
TMS1Q12116 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt7.64□□□□□ -1.19
TMS1Q12116 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt7.64□□□□□ -1.19
TMS1Q12116 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt7.64□□□□□ -1.19
TMS1Q12116 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt7.64□□□□□ -1.19
TMS1Q12116 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7.64□□□□□ -1.19
TMS1Q12116 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt7.64□□□□□ -1.19
TMS1Q12116 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.63□□□□□ -1.19
TMS1Q12116 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.63□□□□□ -1.19
TMS1Q12116 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.63□□□□□ -1.19
TMS1Q12116 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.63□□□□□ -1.19
TMS1Q12116 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.63□□□□□ -1.19
TMS1Q12116 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt7.63□□□□□ -1.19
TMS1Q12116 EDC2YER035W 438 nt7.63□□□□□ -1.19
TMS1Q12116 YGR210CYGR210C 1236 nt7.63□□□□□ -1.19
TMS1Q12116 FCY1YPR062W 477 nt7.63□□□□□ -1.19
TMS1Q12116 YMR265CYMR265C 1386 nt7.62□□□□□ -1.19
TMS1Q12116 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.62□□□□□ -1.19
TMS1Q12116 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.62□□□□□ -1.19
TMS1Q12116 ELO1YJL196C 933 nt7.62□□□□□ -1.19
TMS1Q12116 SRP102YKL154W 735 nt7.62□□□□□ -1.19
TMS1Q12116 MRP1YDR347W 966 nt7.61□□□□□ -1.19
TMS1Q12116 TPC1YGR096W 945 nt7.61□□□□□ -1.19
TMS1Q12116 YKR012CYKR012C 378 nt7.61□□□□□ -1.19
TMS1Q12116 SUV3YPL029W 2214 nt7.61□□□□□ -1.19
TMS1Q12116 MDL2YPL270W 2322 nt7.61□□□□□ -1.19
TMS1Q12116 EMC3YKL207W 762 nt7.59□□□□□ -1.19
TMS1Q12116 YMR206WYMR206W 942 nt7.59□□□□□ -1.19
TMS1Q12116 NSG2YNL156C 900 nt7.59□□□□□ -1.19
TMS1Q12116 MIM1YOL026C 342 nt7.59□□□□□ -1.19
TMS1Q12116 ERO1YML130C 1692 nt7.59□□□□□ -1.19
TMS1Q12116 HBS1YKR084C 1836 nt7.59□□□□□ -1.19
TMS1Q12116 AMF1YOR378W 1548 nt7.58□□□□□ -1.2
TMS1Q12116 YDR467CYDR467C 327 nt7.58□□□□□ -1.2
TMS1Q12116 OPI3YJR073C 621 nt7.58□□□□□ -1.2
TMS1Q12116 YNR064CYNR064C 873 nt7.58□□□□□ -1.2
TMS1Q12116 HAP5YOR358W 729 nt7.58□□□□□ -1.2
TMS1Q12116 ENO1YGR254W 1314 nt7.57□□□□□ -1.2
TMS1Q12116 YLR280CYLR280C 351 nt7.57□□□□□ -1.2
TMS1Q12116 LEU2YCL018W 1095 nt7.57□□□□□ -1.2
TMS1Q12116 GNP1YDR508C 1992 nt7.57□□□□□ -1.2
TMS1Q12116 DUR3YHL016C 2208 nt7.56□□□□□ -1.2
TMS1Q12116 TRP2YER090W 1524 nt7.55□□□□□ -1.2
TMS1Q12116 HXT11YOL156W 1704 nt7.55□□□□□ -1.2
TMS1Q12116 SDS24YBR214W 1584 nt7.54□□□□□ -1.2
TMS1Q12116 SFL1YOR140W 2301 nt7.54□□□□□ -1.2
TMS1Q12116 YPL108WYPL108W 507 nt7.54□□□□□ -1.2
TMS1Q12116 YLR173WYLR173W 1827 nt7.53□□□□□ -1.2
TMS1Q12116 MTO1YGL236C 2010 nt7.53□□□□□ -1.2
TMS1Q12116 YJL160CYJL160C 864 nt7.53□□□□□ -1.2
TMS1Q12116 THI6YPL214C 1623 nt7.52□□□□□ -1.2
TMS1Q12116 KEL3YPL263C 1956 nt7.52□□□□□ -1.21
TMS1Q12116 YMR210WYMR210W 1350 nt7.52□□□□□ -1.21
TMS1Q12116 KAE1YKR038C 1161 nt7.52□□□□□ -1.21
TMS1Q12116 RPN14YGL004C 1254 nt7.51□□□□□ -1.21
TMS1Q12116 CRC1YOR100C 984 nt7.51□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.6 ms