Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AmbpQ07456 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AmbpQ07456 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AmbpQ07456 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AmbpQ07456 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AmbpQ07456 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AmbpQ07456 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AmbpQ07456 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AmbpQ07456 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
AmbpQ07456 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AmbpQ07456 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AmbpQ07456 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AmbpQ07456 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AmbpQ07456 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
AmbpQ07456 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AmbpQ07456 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AmbpQ07456 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
AmbpQ07456 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
AmbpQ07456 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
AmbpQ07456 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
AmbpQ07456 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AmbpQ07456 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AmbpQ07456 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AmbpQ07456 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AmbpQ07456 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AmbpQ07456 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AmbpQ07456 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AmbpQ07456 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AmbpQ07456 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AmbpQ07456 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AmbpQ07456 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AmbpQ07456 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AmbpQ07456 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AmbpQ07456 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AmbpQ07456 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AmbpQ07456 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AmbpQ07456 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AmbpQ07456 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
AmbpQ07456 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AmbpQ07456 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AmbpQ07456 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AmbpQ07456 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AmbpQ07456 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AmbpQ07456 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AmbpQ07456 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
AmbpQ07456 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AmbpQ07456 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AmbpQ07456 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
AmbpQ07456 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AmbpQ07456 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
AmbpQ07456 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AmbpQ07456 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AmbpQ07456 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AmbpQ07456 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AmbpQ07456 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AmbpQ07456 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AmbpQ07456 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
AmbpQ07456 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AmbpQ07456 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AmbpQ07456 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AmbpQ07456 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AmbpQ07456 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AmbpQ07456 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AmbpQ07456 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AmbpQ07456 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AmbpQ07456 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AmbpQ07456 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AmbpQ07456 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AmbpQ07456 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AmbpQ07456 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AmbpQ07456 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AmbpQ07456 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AmbpQ07456 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AmbpQ07456 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AmbpQ07456 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AmbpQ07456 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AmbpQ07456 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AmbpQ07456 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AmbpQ07456 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AmbpQ07456 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AmbpQ07456 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AmbpQ07456 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AmbpQ07456 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AmbpQ07456 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AmbpQ07456 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AmbpQ07456 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AmbpQ07456 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AmbpQ07456 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AmbpQ07456 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AmbpQ07456 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AmbpQ07456 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AmbpQ07456 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AmbpQ07456 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AmbpQ07456 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AmbpQ07456 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AmbpQ07456 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AmbpQ07456 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AmbpQ07456 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AmbpQ07456 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AmbpQ07456 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms