Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC63Q05C16 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC63Q05C16 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC63Q05C16 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC63Q05C16 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC63Q05C16 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC63Q05C16 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC63Q05C16 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC63Q05C16 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
LRRC63Q05C16 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC63Q05C16 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC63Q05C16 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC63Q05C16 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC63Q05C16 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC63Q05C16 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC63Q05C16 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC63Q05C16 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC63Q05C16 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC63Q05C16 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC63Q05C16 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC63Q05C16 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRC63Q05C16 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRC63Q05C16 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC63Q05C16 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC63Q05C16 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC63Q05C16 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC63Q05C16 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC63Q05C16 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC63Q05C16 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRC63Q05C16 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRC63Q05C16 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRC63Q05C16 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC63Q05C16 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC63Q05C16 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC63Q05C16 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC63Q05C16 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC63Q05C16 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC63Q05C16 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC63Q05C16 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC63Q05C16 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC63Q05C16 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC63Q05C16 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC63Q05C16 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC63Q05C16 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC63Q05C16 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC63Q05C16 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRC63Q05C16 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRC63Q05C16 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRC63Q05C16 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
LRRC63Q05C16 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC63Q05C16 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC63Q05C16 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC63Q05C16 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC63Q05C16 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC63Q05C16 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC63Q05C16 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC63Q05C16 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC63Q05C16 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC63Q05C16 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC63Q05C16 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC63Q05C16 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC63Q05C16 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC63Q05C16 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC63Q05C16 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC63Q05C16 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC63Q05C16 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC63Q05C16 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC63Q05C16 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC63Q05C16 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC63Q05C16 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC63Q05C16 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC63Q05C16 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC63Q05C16 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC63Q05C16 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC63Q05C16 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC63Q05C16 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC63Q05C16 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC63Q05C16 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC63Q05C16 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC63Q05C16 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC63Q05C16 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC63Q05C16 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC63Q05C16 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC63Q05C16 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC63Q05C16 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC63Q05C16 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC63Q05C16 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC63Q05C16 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC63Q05C16 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC63Q05C16 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
LRRC63Q05C16 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC63Q05C16 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC63Q05C16 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC63Q05C16 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC63Q05C16 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC63Q05C16 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC63Q05C16 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC63Q05C16 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC63Q05C16 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC63Q05C16 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms