Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIN1Q05586 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIN1Q05586 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GRIN1Q05586 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GRIN1Q05586 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GRIN1Q05586 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GRIN1Q05586 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN1Q05586 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN1Q05586 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN1Q05586 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN1Q05586 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN1Q05586 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN1Q05586 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIN1Q05586 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIN1Q05586 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIN1Q05586 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIN1Q05586 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIN1Q05586 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIN1Q05586 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIN1Q05586 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GRIN1Q05586 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GRIN1Q05586 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GRIN1Q05586 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GRIN1Q05586 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GRIN1Q05586 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GRIN1Q05586 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GRIN1Q05586 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
GRIN1Q05586 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GRIN1Q05586 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GRIN1Q05586 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GRIN1Q05586 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GRIN1Q05586 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GRIN1Q05586 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GRIN1Q05586 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GRIN1Q05586 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GRIN1Q05586 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GRIN1Q05586 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GRIN1Q05586 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GRIN1Q05586 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GRIN1Q05586 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIN1Q05586 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIN1Q05586 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIN1Q05586 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIN1Q05586 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIN1Q05586 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIN1Q05586 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIN1Q05586 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIN1Q05586 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GRIN1Q05586 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
GRIN1Q05586 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GRIN1Q05586 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GRIN1Q05586 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GRIN1Q05586 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GRIN1Q05586 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GRIN1Q05586 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GRIN1Q05586 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GRIN1Q05586 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GRIN1Q05586 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GRIN1Q05586 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GRIN1Q05586 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GRIN1Q05586 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GRIN1Q05586 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIN1Q05586 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIN1Q05586 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIN1Q05586 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIN1Q05586 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIN1Q05586 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GRIN1Q05586 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GRIN1Q05586 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GRIN1Q05586 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIN1Q05586 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIN1Q05586 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIN1Q05586 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIN1Q05586 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIN1Q05586 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GRIN1Q05586 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
GRIN1Q05586 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
GRIN1Q05586 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GRIN1Q05586 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GRIN1Q05586 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GRIN1Q05586 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
GRIN1Q05586 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GRIN1Q05586 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIN1Q05586 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIN1Q05586 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIN1Q05586 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GRIN1Q05586 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
GRIN1Q05586 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIN1Q05586 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
GRIN1Q05586 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
GRIN1Q05586 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GRIN1Q05586 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GRIN1Q05586 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
GRIN1Q05586 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GRIN1Q05586 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GRIN1Q05586 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIN1Q05586 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GRIN1Q05586 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GRIN1Q05586 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GRIN1Q05586 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms