Protein–RNA interactions for Protein: Q04006

UPS3, Protein UPS3, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UPS3Q04006 YDR467CYDR467C 327 nt6.74□□□□□ -1.33
UPS3Q04006 DDI1YER143W 1287 nt6.74□□□□□ -1.33
UPS3Q04006 ATP10YLR393W 840 nt6.74□□□□□ -1.33
UPS3Q04006 MDH2YOL126C 1134 nt6.74□□□□□ -1.33
UPS3Q04006 YJL055WYJL055W 738 nt6.73□□□□□ -1.33
UPS3Q04006 TMA23YMR269W 636 nt6.73□□□□□ -1.33
UPS3Q04006 DIA4YHR011W 1341 nt6.73□□□□□ -1.33
UPS3Q04006 FTH1YBR207W 1398 nt6.72□□□□□ -1.33
UPS3Q04006 ATO2YNR002C 849 nt6.72□□□□□ -1.33
UPS3Q04006 YMR265CYMR265C 1386 nt6.71□□□□□ -1.33
UPS3Q04006 IMO32YGR031W 1029 nt6.71□□□□□ -1.34
UPS3Q04006 YNR064CYNR064C 873 nt6.71□□□□□ -1.34
UPS3Q04006 YPI1YFR003C 468 nt6.7□□□□□ -1.34
UPS3Q04006 YJR114WYJR114W 393 nt6.7□□□□□ -1.34
UPS3Q04006 HAP5YOR358W 729 nt6.7□□□□□ -1.34
UPS3Q04006 SNU66YOR308C 1764 nt6.69□□□□□ -1.34
UPS3Q04006 ADE8YDR408C 645 nt6.69□□□□□ -1.34
UPS3Q04006 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt6.69□□□□□ -1.34
UPS3Q04006 snR31snR31 225 nt6.69□□□□□ -1.34
UPS3Q04006 SAC7YDR389W 1965 nt6.69□□□□□ -1.34
UPS3Q04006 KEL3YPL263C 1956 nt6.69□□□□□ -1.34
UPS3Q04006 PMT7YDR307W 1989 nt6.68□□□□□ -1.34
UPS3Q04006 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt6.68□□□□□ -1.34
UPS3Q04006 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt6.68□□□□□ -1.34
UPS3Q04006 GAL3YDR009W 1563 nt6.67□□□□□ -1.34
UPS3Q04006 ELO1YJL196C 933 nt6.67□□□□□ -1.34
UPS3Q04006 SPE4YLR146C 903 nt6.67□□□□□ -1.34
UPS3Q04006 YMR253CYMR253C 1245 nt6.67□□□□□ -1.34
UPS3Q04006 ERR3YMR323W 1314 nt6.67□□□□□ -1.34
UPS3Q04006 ERR1YOR393W 1314 nt6.67□□□□□ -1.34
UPS3Q04006 ERR2YPL281C 1314 nt6.67□□□□□ -1.34
UPS3Q04006 MAS2YHR024C 1449 nt6.67□□□□□ -1.34
UPS3Q04006 HXT13YEL069C 1695 nt6.66□□□□□ -1.34
UPS3Q04006 MSB3YNL293W 1902 nt6.66□□□□□ -1.34
UPS3Q04006 ERG6YML008C 1152 nt6.65□□□□□ -1.34
UPS3Q04006 YNL040WYNL040W 1371 nt6.65□□□□□ -1.35
UPS3Q04006 CAB5YDR196C 726 nt6.64□□□□□ -1.35
UPS3Q04006 EMC3YKL207W 762 nt6.64□□□□□ -1.35
UPS3Q04006 CDC13YDL220C 2775 nt6.63□□□□□ -1.35
UPS3Q04006 YBL095WYBL095W 813 nt6.63□□□□□ -1.35
UPS3Q04006 RIB2YOL066C 1776 nt6.63□□□□□ -1.35
UPS3Q04006 AQR1YNL065W 1761 nt6.62□□□□□ -1.35
UPS3Q04006 YMR210WYMR210W 1350 nt6.61□□□□□ -1.35
UPS3Q04006 SUV3YPL029W 2214 nt6.6□□□□□ -1.35
UPS3Q04006 YMC2YBR104W 990 nt6.6□□□□□ -1.35
UPS3Q04006 AAT1YKL106W 1356 nt6.59□□□□□ -1.35
UPS3Q04006 TVP23YDR084C 600 nt6.59□□□□□ -1.35
UPS3Q04006 YPL264CYPL264C 1062 nt6.59□□□□□ -1.35
UPS3Q04006 YLR072WYLR072W 2082 nt6.59□□□□□ -1.35
UPS3Q04006 GPM1YKL152C 744 nt6.58□□□□□ -1.36
UPS3Q04006 FCP1YMR277W 2199 nt6.57□□□□□ -1.36
UPS3Q04006 OPI3YJR073C 621 nt6.57□□□□□ -1.36
UPS3Q04006 SAM50YNL026W 1455 nt6.57□□□□□ -1.36
UPS3Q04006 YMR244WYMR244W 1068 nt6.56□□□□□ -1.36
UPS3Q04006 CRC1YOR100C 984 nt6.56□□□□□ -1.36
UPS3Q04006 IML3YBR107C 738 nt6.56□□□□□ -1.36
UPS3Q04006 SPS100YHR139C 981 nt6.55□□□□□ -1.36
UPS3Q04006 HXT9YJL219W 1704 nt6.55□□□□□ -1.36
UPS3Q04006 ENO2YHR174W 1314 nt6.54□□□□□ -1.36
UPS3Q04006 GGA2YHR108W 1758 nt6.54□□□□□ -1.36
UPS3Q04006 YER152CYER152C 1332 nt6.53□□□□□ -1.36
UPS3Q04006 POB3YML069W 1659 nt6.53□□□□□ -1.36
UPS3Q04006 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt6.53□□□□□ -1.36
UPS3Q04006 SWT21YNL187W 1074 nt6.53□□□□□ -1.36
UPS3Q04006 MET1YKR069W 1782 nt6.53□□□□□ -1.36
UPS3Q04006 YBL111CYBL111C 2004 nt6.53□□□□□ -1.36
UPS3Q04006 SBP1YHL034C 885 nt6.52□□□□□ -1.37
UPS3Q04006 YNR029CYNR029C 1290 nt6.52□□□□□ -1.37
UPS3Q04006 GNP1YDR508C 1992 nt6.51□□□□□ -1.37
UPS3Q04006 AMF1YOR378W 1548 nt6.51□□□□□ -1.37
UPS3Q04006 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt6.51□□□□□ -1.37
UPS3Q04006 RBG2YGR173W 1107 nt6.51□□□□□ -1.37
UPS3Q04006 MRS4YKR052C 915 nt6.51□□□□□ -1.37
UPS3Q04006 ABZ2YMR289W 1125 nt6.51□□□□□ -1.37
UPS3Q04006 YPR126CYPR126C 309 nt6.51□□□□□ -1.37
UPS3Q04006 KGD2YDR148C 1392 nt6.5□□□□□ -1.37
UPS3Q04006 MCM5YLR274W 2328 nt6.49□□□□□ -1.37
UPS3Q04006 ADH1YOL086C 1047 nt6.48□□□□□ -1.37
UPS3Q04006 CCT5YJR064W 1689 nt6.48□□□□□ -1.37
UPS3Q04006 LEA1YPL213W 717 nt6.47□□□□□ -1.37
UPS3Q04006 CTI6YPL181W 1521 nt6.46□□□□□ -1.37
UPS3Q04006 THI3YDL080C 1830 nt6.46□□□□□ -1.37
UPS3Q04006 SNZ1YMR096W 894 nt6.46□□□□□ -1.38
UPS3Q04006 YKL053WYKL053W 375 nt6.45□□□□□ -1.38
UPS3Q04006 LEU2YCL018W 1095 nt6.45□□□□□ -1.38
UPS3Q04006 YEL023CYEL023C 2049 nt6.45□□□□□ -1.38
UPS3Q04006 APS2YJR058C 444 nt6.44□□□□□ -1.38
UPS3Q04006 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt6.44□□□□□ -1.38
UPS3Q04006 ADH6YMR318C 1083 nt6.44□□□□□ -1.38
UPS3Q04006 GUT1YHL032C 2130 nt6.44□□□□□ -1.38
UPS3Q04006 MHF1YOL086W-A 273 nt6.43□□□□□ -1.38
UPS3Q04006 WSC4YHL028W 1818 nt6.43□□□□□ -1.38
UPS3Q04006 SAN1YDR143C 1833 nt6.42□□□□□ -1.38
UPS3Q04006 TAF13YML098W 504 nt6.42□□□□□ -1.38
UPS3Q04006 SRP54YPR088C 1626 nt6.42□□□□□ -1.38
UPS3Q04006 BAP3YDR046C 1815 nt6.41□□□□□ -1.38
UPS3Q04006 RRT6YGL146C 936 nt6.41□□□□□ -1.38
UPS3Q04006 ESS1YJR017C 513 nt6.41□□□□□ -1.38
UPS3Q04006 ABP1YCR088W 1779 nt6.41□□□□□ -1.38
UPS3Q04006 GAS1YMR307W 1680 nt6.4□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.8 ms