Protein–RNA interactions for Protein: Q03403

TFF2, Trefoil factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF2Q03403 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TFF2Q03403 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TFF2Q03403 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TFF2Q03403 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TFF2Q03403 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TFF2Q03403 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TFF2Q03403 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TFF2Q03403 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TFF2Q03403 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TFF2Q03403 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TFF2Q03403 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TFF2Q03403 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TFF2Q03403 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TFF2Q03403 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TFF2Q03403 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TFF2Q03403 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TFF2Q03403 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TFF2Q03403 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TFF2Q03403 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TFF2Q03403 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TFF2Q03403 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TFF2Q03403 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TFF2Q03403 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TFF2Q03403 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TFF2Q03403 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TFF2Q03403 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TFF2Q03403 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TFF2Q03403 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TFF2Q03403 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TFF2Q03403 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TFF2Q03403 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TFF2Q03403 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TFF2Q03403 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TFF2Q03403 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TFF2Q03403 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TFF2Q03403 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TFF2Q03403 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TFF2Q03403 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TFF2Q03403 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TFF2Q03403 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TFF2Q03403 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TFF2Q03403 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TFF2Q03403 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TFF2Q03403 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TFF2Q03403 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TFF2Q03403 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TFF2Q03403 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TFF2Q03403 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TFF2Q03403 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TFF2Q03403 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TFF2Q03403 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TFF2Q03403 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TFF2Q03403 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TFF2Q03403 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TFF2Q03403 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TFF2Q03403 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TFF2Q03403 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TFF2Q03403 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TFF2Q03403 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TFF2Q03403 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TFF2Q03403 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TFF2Q03403 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TFF2Q03403 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TFF2Q03403 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TFF2Q03403 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TFF2Q03403 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TFF2Q03403 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
TFF2Q03403 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TFF2Q03403 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TFF2Q03403 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TFF2Q03403 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TFF2Q03403 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TFF2Q03403 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TFF2Q03403 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TFF2Q03403 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TFF2Q03403 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TFF2Q03403 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TFF2Q03403 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TFF2Q03403 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TFF2Q03403 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TFF2Q03403 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TFF2Q03403 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TFF2Q03403 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TFF2Q03403 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TFF2Q03403 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TFF2Q03403 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TFF2Q03403 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TFF2Q03403 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TFF2Q03403 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TFF2Q03403 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TFF2Q03403 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TFF2Q03403 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TFF2Q03403 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TFF2Q03403 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TFF2Q03403 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TFF2Q03403 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TFF2Q03403 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TFF2Q03403 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TFF2Q03403 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TFF2Q03403 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms