Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ActbP60710 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ActbP60710 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ActbP60710 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ActbP60710 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ActbP60710 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ActbP60710 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ActbP60710 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ActbP60710 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ActbP60710 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ActbP60710 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ActbP60710 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ActbP60710 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ActbP60710 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ActbP60710 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ActbP60710 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ActbP60710 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ActbP60710 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ActbP60710 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ActbP60710 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ActbP60710 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ActbP60710 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ActbP60710 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ActbP60710 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ActbP60710 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ActbP60710 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ActbP60710 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ActbP60710 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ActbP60710 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ActbP60710 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ActbP60710 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ActbP60710 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ActbP60710 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ActbP60710 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ActbP60710 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ActbP60710 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ActbP60710 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ActbP60710 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ActbP60710 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ActbP60710 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ActbP60710 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ActbP60710 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ActbP60710 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ActbP60710 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ActbP60710 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ActbP60710 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ActbP60710 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ActbP60710 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ActbP60710 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ActbP60710 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ActbP60710 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ActbP60710 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ActbP60710 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ActbP60710 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ActbP60710 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ActbP60710 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ActbP60710 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ActbP60710 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ActbP60710 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ActbP60710 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ActbP60710 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ActbP60710 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ActbP60710 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ActbP60710 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ActbP60710 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ActbP60710 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ActbP60710 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ActbP60710 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ActbP60710 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ActbP60710 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ActbP60710 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ActbP60710 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ActbP60710 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ActbP60710 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ActbP60710 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ActbP60710 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ActbP60710 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ActbP60710 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ActbP60710 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ActbP60710 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ActbP60710 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ActbP60710 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ActbP60710 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ActbP60710 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ActbP60710 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ActbP60710 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ActbP60710 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ActbP60710 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ActbP60710 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ActbP60710 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ActbP60710 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ActbP60710 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ActbP60710 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ActbP60710 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ActbP60710 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ActbP60710 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ActbP60710 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ActbP60710 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ActbP60710 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ActbP60710 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms