Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP6P55212 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP6P55212 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP6P55212 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP6P55212 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CASP6P55212 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CASP6P55212 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP6P55212 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP6P55212 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP6P55212 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP6P55212 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP6P55212 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP6P55212 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP6P55212 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP6P55212 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP6P55212 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP6P55212 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP6P55212 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP6P55212 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP6P55212 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP6P55212 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP6P55212 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP6P55212 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP6P55212 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP6P55212 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP6P55212 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP6P55212 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP6P55212 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP6P55212 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP6P55212 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP6P55212 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP6P55212 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP6P55212 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP6P55212 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP6P55212 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP6P55212 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP6P55212 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP6P55212 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP6P55212 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP6P55212 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP6P55212 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP6P55212 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP6P55212 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP6P55212 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP6P55212 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP6P55212 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP6P55212 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP6P55212 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP6P55212 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP6P55212 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP6P55212 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP6P55212 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP6P55212 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP6P55212 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP6P55212 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP6P55212 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP6P55212 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP6P55212 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP6P55212 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP6P55212 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP6P55212 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP6P55212 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASP6P55212 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP6P55212 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CASP6P55212 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP6P55212 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP6P55212 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP6P55212 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP6P55212 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP6P55212 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP6P55212 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP6P55212 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP6P55212 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP6P55212 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASP6P55212 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP6P55212 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP6P55212 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASP6P55212 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASP6P55212 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP6P55212 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASP6P55212 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP6P55212 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP6P55212 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP6P55212 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP6P55212 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASP6P55212 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP6P55212 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP6P55212 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP6P55212 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASP6P55212 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP6P55212 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP6P55212 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASP6P55212 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CASP6P55212 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CASP6P55212 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP6P55212 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP6P55212 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASP6P55212 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP6P55212 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASP6P55212 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms