Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
BRCA2P51587 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
BRCA2P51587 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
BRCA2P51587 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
BRCA2P51587 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
BRCA2P51587 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BRCA2P51587 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
BRCA2P51587 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BRCA2P51587 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
BRCA2P51587 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
BRCA2P51587 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BRCA2P51587 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
BRCA2P51587 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
BRCA2P51587 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
BRCA2P51587 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
BRCA2P51587 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
BRCA2P51587 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
BRCA2P51587 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
BRCA2P51587 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
BRCA2P51587 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
BRCA2P51587 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
BRCA2P51587 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
BRCA2P51587 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
BRCA2P51587 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
BRCA2P51587 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
BRCA2P51587 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
BRCA2P51587 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
BRCA2P51587 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
BRCA2P51587 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
BRCA2P51587 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
BRCA2P51587 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
BRCA2P51587 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
BRCA2P51587 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
BRCA2P51587 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
BRCA2P51587 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BRCA2P51587 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BRCA2P51587 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BRCA2P51587 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
BRCA2P51587 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
BRCA2P51587 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
BRCA2P51587 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
BRCA2P51587 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
BRCA2P51587 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
BRCA2P51587 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
BRCA2P51587 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
BRCA2P51587 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
BRCA2P51587 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BRCA2P51587 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BRCA2P51587 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BRCA2P51587 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
BRCA2P51587 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BRCA2P51587 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BRCA2P51587 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
BRCA2P51587 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BRCA2P51587 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
BRCA2P51587 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BRCA2P51587 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BRCA2P51587 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
BRCA2P51587 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
BRCA2P51587 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BRCA2P51587 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
BRCA2P51587 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
BRCA2P51587 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
BRCA2P51587 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BRCA2P51587 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
BRCA2P51587 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
BRCA2P51587 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
BRCA2P51587 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
BRCA2P51587 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
BRCA2P51587 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BRCA2P51587 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BRCA2P51587 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BRCA2P51587 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BRCA2P51587 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BRCA2P51587 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BRCA2P51587 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
BRCA2P51587 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
BRCA2P51587 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
BRCA2P51587 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
BRCA2P51587 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
BRCA2P51587 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
BRCA2P51587 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
BRCA2P51587 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
BRCA2P51587 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
BRCA2P51587 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
BRCA2P51587 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
BRCA2P51587 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
BRCA2P51587 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
BRCA2P51587 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
BRCA2P51587 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BRCA2P51587 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BRCA2P51587 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
BRCA2P51587 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
BRCA2P51587 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
BRCA2P51587 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
BRCA2P51587 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
BRCA2P51587 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
BRCA2P51587 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
BRCA2P51587 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BRCA2P51587 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms