Protein–RNA interactions for Protein: P40429

RPL13A, 60S ribosomal protein L13a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13AP40429 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPL13AP40429 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPL13AP40429 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPL13AP40429 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPL13AP40429 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPL13AP40429 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPL13AP40429 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPL13AP40429 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL13AP40429 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL13AP40429 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL13AP40429 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL13AP40429 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL13AP40429 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL13AP40429 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL13AP40429 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL13AP40429 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL13AP40429 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL13AP40429 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL13AP40429 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL13AP40429 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPL13AP40429 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPL13AP40429 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPL13AP40429 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPL13AP40429 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPL13AP40429 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPL13AP40429 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPL13AP40429 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL13AP40429 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL13AP40429 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL13AP40429 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL13AP40429 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL13AP40429 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL13AP40429 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL13AP40429 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL13AP40429 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL13AP40429 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL13AP40429 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL13AP40429 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL13AP40429 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL13AP40429 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL13AP40429 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL13AP40429 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL13AP40429 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL13AP40429 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL13AP40429 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL13AP40429 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL13AP40429 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL13AP40429 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL13AP40429 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL13AP40429 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL13AP40429 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPL13AP40429 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL13AP40429 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL13AP40429 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL13AP40429 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL13AP40429 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL13AP40429 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL13AP40429 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL13AP40429 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL13AP40429 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL13AP40429 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL13AP40429 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL13AP40429 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL13AP40429 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL13AP40429 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL13AP40429 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL13AP40429 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL13AP40429 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL13AP40429 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL13AP40429 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL13AP40429 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL13AP40429 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL13AP40429 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL13AP40429 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL13AP40429 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL13AP40429 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL13AP40429 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL13AP40429 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL13AP40429 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL13AP40429 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL13AP40429 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL13AP40429 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL13AP40429 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL13AP40429 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL13AP40429 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL13AP40429 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
RPL13AP40429 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL13AP40429 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL13AP40429 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL13AP40429 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL13AP40429 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL13AP40429 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL13AP40429 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL13AP40429 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL13AP40429 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL13AP40429 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL13AP40429 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL13AP40429 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL13AP40429 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL13AP40429 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms