Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apex1P28352 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apex1P28352 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apex1P28352 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Apex1P28352 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apex1P28352 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apex1P28352 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apex1P28352 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apex1P28352 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apex1P28352 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apex1P28352 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Apex1P28352 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apex1P28352 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apex1P28352 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apex1P28352 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apex1P28352 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apex1P28352 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apex1P28352 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apex1P28352 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apex1P28352 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Apex1P28352 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apex1P28352 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apex1P28352 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apex1P28352 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apex1P28352 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apex1P28352 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apex1P28352 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apex1P28352 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apex1P28352 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apex1P28352 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apex1P28352 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Apex1P28352 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Apex1P28352 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apex1P28352 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apex1P28352 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apex1P28352 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apex1P28352 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Apex1P28352 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apex1P28352 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apex1P28352 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apex1P28352 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apex1P28352 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apex1P28352 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apex1P28352 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apex1P28352 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apex1P28352 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apex1P28352 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apex1P28352 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apex1P28352 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apex1P28352 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apex1P28352 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apex1P28352 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apex1P28352 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apex1P28352 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apex1P28352 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apex1P28352 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apex1P28352 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apex1P28352 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apex1P28352 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apex1P28352 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Apex1P28352 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apex1P28352 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apex1P28352 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apex1P28352 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apex1P28352 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apex1P28352 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apex1P28352 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apex1P28352 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apex1P28352 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apex1P28352 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apex1P28352 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apex1P28352 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apex1P28352 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apex1P28352 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apex1P28352 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apex1P28352 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apex1P28352 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apex1P28352 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apex1P28352 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apex1P28352 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apex1P28352 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apex1P28352 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apex1P28352 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apex1P28352 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apex1P28352 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apex1P28352 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apex1P28352 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apex1P28352 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apex1P28352 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apex1P28352 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apex1P28352 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apex1P28352 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apex1P28352 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apex1P28352 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apex1P28352 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apex1P28352 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Apex1P28352 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Apex1P28352 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apex1P28352 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apex1P28352 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms