Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC9A1P19634 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC9A1P19634 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC9A1P19634 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC9A1P19634 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC9A1P19634 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC9A1P19634 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC9A1P19634 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC9A1P19634 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC9A1P19634 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC9A1P19634 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC9A1P19634 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC9A1P19634 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC9A1P19634 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC9A1P19634 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC9A1P19634 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC9A1P19634 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC9A1P19634 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC9A1P19634 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC9A1P19634 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC9A1P19634 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC9A1P19634 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC9A1P19634 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC9A1P19634 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC9A1P19634 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC9A1P19634 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC9A1P19634 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC9A1P19634 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC9A1P19634 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC9A1P19634 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC9A1P19634 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC9A1P19634 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
SLC9A1P19634 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC9A1P19634 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC9A1P19634 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC9A1P19634 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC9A1P19634 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC9A1P19634 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC9A1P19634 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC9A1P19634 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC9A1P19634 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC9A1P19634 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC9A1P19634 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC9A1P19634 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC9A1P19634 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC9A1P19634 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC9A1P19634 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC9A1P19634 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC9A1P19634 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC9A1P19634 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC9A1P19634 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC9A1P19634 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC9A1P19634 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC9A1P19634 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC9A1P19634 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC9A1P19634 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC9A1P19634 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
SLC9A1P19634 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC9A1P19634 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC9A1P19634 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC9A1P19634 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC9A1P19634 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC9A1P19634 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC9A1P19634 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC9A1P19634 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC9A1P19634 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC9A1P19634 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC9A1P19634 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC9A1P19634 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC9A1P19634 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC9A1P19634 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC9A1P19634 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC9A1P19634 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC9A1P19634 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC9A1P19634 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC9A1P19634 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC9A1P19634 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC9A1P19634 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC9A1P19634 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC9A1P19634 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC9A1P19634 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC9A1P19634 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC9A1P19634 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC9A1P19634 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC9A1P19634 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC9A1P19634 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC9A1P19634 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC9A1P19634 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC9A1P19634 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC9A1P19634 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC9A1P19634 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC9A1P19634 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC9A1P19634 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC9A1P19634 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC9A1P19634 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC9A1P19634 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC9A1P19634 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC9A1P19634 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC9A1P19634 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC9A1P19634 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms