Protein–RNA interactions for Protein: P0DI80

SMIM6, Small integral membrane protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM6P0DI80 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM6P0DI80 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM6P0DI80 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM6P0DI80 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM6P0DI80 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMIM6P0DI80 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMIM6P0DI80 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM6P0DI80 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM6P0DI80 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM6P0DI80 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM6P0DI80 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM6P0DI80 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM6P0DI80 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM6P0DI80 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM6P0DI80 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM6P0DI80 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM6P0DI80 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMIM6P0DI80 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMIM6P0DI80 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMIM6P0DI80 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMIM6P0DI80 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMIM6P0DI80 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMIM6P0DI80 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMIM6P0DI80 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMIM6P0DI80 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMIM6P0DI80 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMIM6P0DI80 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMIM6P0DI80 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMIM6P0DI80 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMIM6P0DI80 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMIM6P0DI80 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM6P0DI80 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM6P0DI80 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM6P0DI80 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM6P0DI80 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMIM6P0DI80 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM6P0DI80 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM6P0DI80 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM6P0DI80 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SMIM6P0DI80 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM6P0DI80 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM6P0DI80 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM6P0DI80 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM6P0DI80 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM6P0DI80 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM6P0DI80 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM6P0DI80 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM6P0DI80 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM6P0DI80 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM6P0DI80 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM6P0DI80 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM6P0DI80 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM6P0DI80 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM6P0DI80 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM6P0DI80 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM6P0DI80 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM6P0DI80 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM6P0DI80 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM6P0DI80 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM6P0DI80 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM6P0DI80 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM6P0DI80 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM6P0DI80 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM6P0DI80 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM6P0DI80 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM6P0DI80 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM6P0DI80 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM6P0DI80 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM6P0DI80 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SMIM6P0DI80 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMIM6P0DI80 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMIM6P0DI80 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMIM6P0DI80 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMIM6P0DI80 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMIM6P0DI80 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMIM6P0DI80 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMIM6P0DI80 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMIM6P0DI80 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMIM6P0DI80 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMIM6P0DI80 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMIM6P0DI80 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMIM6P0DI80 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMIM6P0DI80 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMIM6P0DI80 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMIM6P0DI80 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SMIM6P0DI80 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMIM6P0DI80 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMIM6P0DI80 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMIM6P0DI80 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMIM6P0DI80 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMIM6P0DI80 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMIM6P0DI80 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMIM6P0DI80 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SMIM6P0DI80 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMIM6P0DI80 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMIM6P0DI80 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMIM6P0DI80 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMIM6P0DI80 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMIM6P0DI80 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMIM6P0DI80 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms