Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RHOBTB3O94955 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RHOBTB3O94955 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
RHOBTB3O94955 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
RHOBTB3O94955 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RHOBTB3O94955 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
RHOBTB3O94955 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RHOBTB3O94955 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RHOBTB3O94955 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RHOBTB3O94955 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RHOBTB3O94955 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
RHOBTB3O94955 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RHOBTB3O94955 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RHOBTB3O94955 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RHOBTB3O94955 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RHOBTB3O94955 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RHOBTB3O94955 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RHOBTB3O94955 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RHOBTB3O94955 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RHOBTB3O94955 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RHOBTB3O94955 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RHOBTB3O94955 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RHOBTB3O94955 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RHOBTB3O94955 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RHOBTB3O94955 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RHOBTB3O94955 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RHOBTB3O94955 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RHOBTB3O94955 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RHOBTB3O94955 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RHOBTB3O94955 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RHOBTB3O94955 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RHOBTB3O94955 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RHOBTB3O94955 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RHOBTB3O94955 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RHOBTB3O94955 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RHOBTB3O94955 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RHOBTB3O94955 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RHOBTB3O94955 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RHOBTB3O94955 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RHOBTB3O94955 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RHOBTB3O94955 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RHOBTB3O94955 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RHOBTB3O94955 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RHOBTB3O94955 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RHOBTB3O94955 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RHOBTB3O94955 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RHOBTB3O94955 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RHOBTB3O94955 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RHOBTB3O94955 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RHOBTB3O94955 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
RHOBTB3O94955 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RHOBTB3O94955 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RHOBTB3O94955 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RHOBTB3O94955 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RHOBTB3O94955 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RHOBTB3O94955 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RHOBTB3O94955 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RHOBTB3O94955 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RHOBTB3O94955 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RHOBTB3O94955 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RHOBTB3O94955 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RHOBTB3O94955 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RHOBTB3O94955 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RHOBTB3O94955 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RHOBTB3O94955 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RHOBTB3O94955 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RHOBTB3O94955 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RHOBTB3O94955 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RHOBTB3O94955 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RHOBTB3O94955 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RHOBTB3O94955 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RHOBTB3O94955 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RHOBTB3O94955 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RHOBTB3O94955 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RHOBTB3O94955 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RHOBTB3O94955 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RHOBTB3O94955 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RHOBTB3O94955 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RHOBTB3O94955 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RHOBTB3O94955 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RHOBTB3O94955 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RHOBTB3O94955 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RHOBTB3O94955 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RHOBTB3O94955 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RHOBTB3O94955 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RHOBTB3O94955 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RHOBTB3O94955 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RHOBTB3O94955 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RHOBTB3O94955 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RHOBTB3O94955 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RHOBTB3O94955 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RHOBTB3O94955 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RHOBTB3O94955 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RHOBTB3O94955 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RHOBTB3O94955 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RHOBTB3O94955 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RHOBTB3O94955 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RHOBTB3O94955 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RHOBTB3O94955 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RHOBTB3O94955 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms