Protein–RNA interactions for Protein: O14594

NCAN, Neurocan core protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCANO14594 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NCANO14594 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCANO14594 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCANO14594 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCANO14594 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCANO14594 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCANO14594 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCANO14594 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCANO14594 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCANO14594 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCANO14594 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NCANO14594 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NCANO14594 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NCANO14594 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NCANO14594 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NCANO14594 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NCANO14594 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NCANO14594 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCANO14594 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCANO14594 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCANO14594 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCANO14594 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCANO14594 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCANO14594 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCANO14594 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCANO14594 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NCANO14594 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NCANO14594 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NCANO14594 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCANO14594 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCANO14594 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCANO14594 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NCANO14594 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCANO14594 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCANO14594 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NCANO14594 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCANO14594 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCANO14594 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NCANO14594 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCANO14594 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCANO14594 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCANO14594 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NCANO14594 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCANO14594 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCANO14594 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCANO14594 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCANO14594 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCANO14594 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NCANO14594 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NCANO14594 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NCANO14594 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NCANO14594 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NCANO14594 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NCANO14594 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NCANO14594 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NCANO14594 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NCANO14594 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NCANO14594 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NCANO14594 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NCANO14594 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NCANO14594 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NCANO14594 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCANO14594 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCANO14594 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCANO14594 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NCANO14594 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCANO14594 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NCANO14594 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCANO14594 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCANO14594 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCANO14594 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCANO14594 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCANO14594 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NCANO14594 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCANO14594 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCANO14594 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCANO14594 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCANO14594 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCANO14594 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCANO14594 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NCANO14594 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NCANO14594 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCANO14594 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCANO14594 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCANO14594 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCANO14594 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCANO14594 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NCANO14594 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NCANO14594 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NCANO14594 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCANO14594 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCANO14594 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCANO14594 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCANO14594 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCANO14594 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCANO14594 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCANO14594 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCANO14594 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCANO14594 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCANO14594 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms