Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY8

Gm19965, Predicted gene, 19965, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm19965J3QNY8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm19965J3QNY8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm19965J3QNY8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm19965J3QNY8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm19965J3QNY8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm19965J3QNY8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm19965J3QNY8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm19965J3QNY8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm19965J3QNY8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm19965J3QNY8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm19965J3QNY8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm19965J3QNY8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm19965J3QNY8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm19965J3QNY8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm19965J3QNY8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm19965J3QNY8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm19965J3QNY8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm19965J3QNY8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm19965J3QNY8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm19965J3QNY8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm19965J3QNY8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm19965J3QNY8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm19965J3QNY8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm19965J3QNY8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm19965J3QNY8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm19965J3QNY8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm19965J3QNY8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm19965J3QNY8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm19965J3QNY8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm19965J3QNY8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm19965J3QNY8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm19965J3QNY8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm19965J3QNY8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm19965J3QNY8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm19965J3QNY8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm19965J3QNY8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm19965J3QNY8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm19965J3QNY8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm19965J3QNY8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm19965J3QNY8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm19965J3QNY8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm19965J3QNY8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm19965J3QNY8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm19965J3QNY8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm19965J3QNY8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm19965J3QNY8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm19965J3QNY8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm19965J3QNY8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm19965J3QNY8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm19965J3QNY8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm19965J3QNY8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm19965J3QNY8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm19965J3QNY8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm19965J3QNY8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm19965J3QNY8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm19965J3QNY8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm19965J3QNY8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm19965J3QNY8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm19965J3QNY8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm19965J3QNY8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm19965J3QNY8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm19965J3QNY8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm19965J3QNY8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm19965J3QNY8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm19965J3QNY8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm19965J3QNY8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm19965J3QNY8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm19965J3QNY8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm19965J3QNY8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm19965J3QNY8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm19965J3QNY8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm19965J3QNY8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm19965J3QNY8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm19965J3QNY8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm19965J3QNY8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm19965J3QNY8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm19965J3QNY8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm19965J3QNY8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm19965J3QNY8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm19965J3QNY8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm19965J3QNY8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm19965J3QNY8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm19965J3QNY8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm19965J3QNY8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm19965J3QNY8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm19965J3QNY8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm19965J3QNY8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm19965J3QNY8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm19965J3QNY8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm19965J3QNY8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm19965J3QNY8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm19965J3QNY8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm19965J3QNY8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm19965J3QNY8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gm19965J3QNY8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm19965J3QNY8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm19965J3QNY8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm19965J3QNY8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm19965J3QNY8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm19965J3QNY8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms