Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7F2

Rnf169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf169E9Q7F2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
Rnf169E9Q7F2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,74■■□□□ 1,39
Rnf169E9Q7F2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23,74■■□□□ 1,39
Rnf169E9Q7F2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23,74■■□□□ 1,39
Rnf169E9Q7F2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
Rnf169E9Q7F2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23,73■■□□□ 1,39
Rnf169E9Q7F2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Rnf169E9Q7F2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
Rnf169E9Q7F2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Rnf169E9Q7F2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Rnf169E9Q7F2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Rnf169E9Q7F2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Rnf169E9Q7F2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Rnf169E9Q7F2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Rnf169E9Q7F2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Rnf169E9Q7F2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23,66■■□□□ 1,38
Rnf169E9Q7F2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Rnf169E9Q7F2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23,66■■□□□ 1,38
Rnf169E9Q7F2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Rnf169E9Q7F2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Rnf169E9Q7F2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Rnf169E9Q7F2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,65■■□□□ 1,38
Rnf169E9Q7F2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,37
Rnf169E9Q7F2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,37
Rnf169E9Q7F2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Rnf169E9Q7F2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Rnf169E9Q7F2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23,62■■□□□ 1,37
Rnf169E9Q7F2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Rnf169E9Q7F2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23,62■■□□□ 1,37
Rnf169E9Q7F2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Rnf169E9Q7F2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Rnf169E9Q7F2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Rnf169E9Q7F2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,58■■□□□ 1,37
Rnf169E9Q7F2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,58■■□□□ 1,36
Rnf169E9Q7F2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Rnf169E9Q7F2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Rnf169E9Q7F2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Rnf169E9Q7F2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23,56■■□□□ 1,36
Rnf169E9Q7F2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Rnf169E9Q7F2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Rnf169E9Q7F2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
Rnf169E9Q7F2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
Rnf169E9Q7F2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
Rnf169E9Q7F2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23,53■■□□□ 1,36
Rnf169E9Q7F2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23,53■■□□□ 1,36
Rnf169E9Q7F2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23,53■■□□□ 1,36
Rnf169E9Q7F2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Rnf169E9Q7F2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Rnf169E9Q7F2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,51■■□□□ 1,35
Rnf169E9Q7F2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23,51■■□□□ 1,35
Rnf169E9Q7F2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Rnf169E9Q7F2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Rnf169E9Q7F2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23,5■■□□□ 1,35
Rnf169E9Q7F2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23,5■■□□□ 1,35
Rnf169E9Q7F2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23,5■■□□□ 1,35
Rnf169E9Q7F2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,49■■□□□ 1,35
Rnf169E9Q7F2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Rnf169E9Q7F2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23,48■■□□□ 1,35
Rnf169E9Q7F2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Rnf169E9Q7F2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23,47■■□□□ 1,35
Rnf169E9Q7F2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23,47■■□□□ 1,35
Rnf169E9Q7F2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Rnf169E9Q7F2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23,47■■□□□ 1,35
Rnf169E9Q7F2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23,47■■□□□ 1,35
Rnf169E9Q7F2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,46■■□□□ 1,35
Rnf169E9Q7F2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23,46■■□□□ 1,35
Rnf169E9Q7F2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
Rnf169E9Q7F2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
Rnf169E9Q7F2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,35
Rnf169E9Q7F2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23,44■■□□□ 1,34
Rnf169E9Q7F2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23,44■■□□□ 1,34
Rnf169E9Q7F2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Rnf169E9Q7F2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Rnf169E9Q7F2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
Rnf169E9Q7F2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
Rnf169E9Q7F2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,43■■□□□ 1,34
Rnf169E9Q7F2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
Rnf169E9Q7F2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Rnf169E9Q7F2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Rnf169E9Q7F2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
Rnf169E9Q7F2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
Rnf169E9Q7F2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
Rnf169E9Q7F2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,34
Rnf169E9Q7F2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,34
Rnf169E9Q7F2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23,39■■□□□ 1,33
Rnf169E9Q7F2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,33
Rnf169E9Q7F2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Rnf169E9Q7F2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Rnf169E9Q7F2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Rnf169E9Q7F2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,38■■□□□ 1,33
Rnf169E9Q7F2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Rnf169E9Q7F2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Rnf169E9Q7F2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Rnf169E9Q7F2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Rnf169E9Q7F2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Rnf169E9Q7F2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23,37■■□□□ 1,33
Rnf169E9Q7F2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,37■■□□□ 1,33
Rnf169E9Q7F2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Rnf169E9Q7F2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23,36■■□□□ 1,33
Rnf169E9Q7F2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
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