Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC00587B1AMM8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC00587B1AMM8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC00587B1AMM8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC00587B1AMM8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC00587B1AMM8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC00587B1AMM8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
LINC00587B1AMM8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
LINC00587B1AMM8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC00587B1AMM8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC00587B1AMM8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC00587B1AMM8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC00587B1AMM8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC00587B1AMM8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC00587B1AMM8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC00587B1AMM8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC00587B1AMM8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LINC00587B1AMM8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LINC00587B1AMM8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LINC00587B1AMM8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LINC00587B1AMM8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LINC00587B1AMM8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LINC00587B1AMM8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LINC00587B1AMM8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LINC00587B1AMM8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LINC00587B1AMM8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LINC00587B1AMM8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LINC00587B1AMM8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LINC00587B1AMM8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LINC00587B1AMM8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LINC00587B1AMM8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LINC00587B1AMM8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LINC00587B1AMM8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LINC00587B1AMM8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LINC00587B1AMM8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LINC00587B1AMM8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LINC00587B1AMM8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LINC00587B1AMM8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LINC00587B1AMM8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LINC00587B1AMM8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LINC00587B1AMM8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LINC00587B1AMM8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LINC00587B1AMM8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LINC00587B1AMM8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LINC00587B1AMM8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LINC00587B1AMM8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LINC00587B1AMM8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LINC00587B1AMM8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LINC00587B1AMM8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LINC00587B1AMM8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LINC00587B1AMM8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LINC00587B1AMM8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LINC00587B1AMM8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
LINC00587B1AMM8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
LINC00587B1AMM8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LINC00587B1AMM8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LINC00587B1AMM8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LINC00587B1AMM8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LINC00587B1AMM8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LINC00587B1AMM8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LINC00587B1AMM8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LINC00587B1AMM8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LINC00587B1AMM8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LINC00587B1AMM8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LINC00587B1AMM8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LINC00587B1AMM8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LINC00587B1AMM8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LINC00587B1AMM8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LINC00587B1AMM8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LINC00587B1AMM8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
LINC00587B1AMM8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LINC00587B1AMM8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LINC00587B1AMM8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LINC00587B1AMM8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LINC00587B1AMM8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LINC00587B1AMM8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
LINC00587B1AMM8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LINC00587B1AMM8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LINC00587B1AMM8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LINC00587B1AMM8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LINC00587B1AMM8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LINC00587B1AMM8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LINC00587B1AMM8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LINC00587B1AMM8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LINC00587B1AMM8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LINC00587B1AMM8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LINC00587B1AMM8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LINC00587B1AMM8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LINC00587B1AMM8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LINC00587B1AMM8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
LINC00587B1AMM8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LINC00587B1AMM8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LINC00587B1AMM8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LINC00587B1AMM8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LINC00587B1AMM8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LINC00587B1AMM8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LINC00587B1AMM8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LINC00587B1AMM8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LINC00587B1AMM8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LINC00587B1AMM8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms