Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
XIRP2A4UGR9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
XIRP2A4UGR9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
XIRP2A4UGR9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
XIRP2A4UGR9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
XIRP2A4UGR9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
XIRP2A4UGR9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
XIRP2A4UGR9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
XIRP2A4UGR9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
XIRP2A4UGR9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
XIRP2A4UGR9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
XIRP2A4UGR9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
XIRP2A4UGR9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
XIRP2A4UGR9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
XIRP2A4UGR9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
XIRP2A4UGR9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
XIRP2A4UGR9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
XIRP2A4UGR9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
XIRP2A4UGR9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
XIRP2A4UGR9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
XIRP2A4UGR9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
XIRP2A4UGR9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
XIRP2A4UGR9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
XIRP2A4UGR9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
XIRP2A4UGR9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
XIRP2A4UGR9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
XIRP2A4UGR9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
XIRP2A4UGR9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
XIRP2A4UGR9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
XIRP2A4UGR9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
XIRP2A4UGR9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
XIRP2A4UGR9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
XIRP2A4UGR9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
XIRP2A4UGR9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
XIRP2A4UGR9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
XIRP2A4UGR9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
XIRP2A4UGR9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
XIRP2A4UGR9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
XIRP2A4UGR9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
XIRP2A4UGR9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
XIRP2A4UGR9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
XIRP2A4UGR9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
XIRP2A4UGR9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
XIRP2A4UGR9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
XIRP2A4UGR9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
XIRP2A4UGR9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
XIRP2A4UGR9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
XIRP2A4UGR9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
XIRP2A4UGR9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
XIRP2A4UGR9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
XIRP2A4UGR9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
XIRP2A4UGR9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
XIRP2A4UGR9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
XIRP2A4UGR9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
XIRP2A4UGR9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
XIRP2A4UGR9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
XIRP2A4UGR9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
XIRP2A4UGR9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
XIRP2A4UGR9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
XIRP2A4UGR9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
XIRP2A4UGR9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.56■■■□□ 2
XIRP2A4UGR9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.54■■■□□ 2
XIRP2A4UGR9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
XIRP2A4UGR9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
XIRP2A4UGR9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
XIRP2A4UGR9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
XIRP2A4UGR9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
XIRP2A4UGR9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
XIRP2A4UGR9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
XIRP2A4UGR9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
XIRP2A4UGR9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
XIRP2A4UGR9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
XIRP2A4UGR9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
XIRP2A4UGR9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
XIRP2A4UGR9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
XIRP2A4UGR9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
XIRP2A4UGR9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
XIRP2A4UGR9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
XIRP2A4UGR9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
XIRP2A4UGR9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
XIRP2A4UGR9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
XIRP2A4UGR9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
XIRP2A4UGR9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
XIRP2A4UGR9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
XIRP2A4UGR9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
XIRP2A4UGR9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
XIRP2A4UGR9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
XIRP2A4UGR9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
XIRP2A4UGR9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
XIRP2A4UGR9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
XIRP2A4UGR9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
XIRP2A4UGR9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
XIRP2A4UGR9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
XIRP2A4UGR9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
XIRP2A4UGR9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
XIRP2A4UGR9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
XIRP2A4UGR9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
XIRP2A4UGR9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
XIRP2A4UGR9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
XIRP2A4UGR9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms