Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC78A2IDD5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC78A2IDD5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC78A2IDD5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC78A2IDD5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC78A2IDD5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC78A2IDD5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC78A2IDD5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC78A2IDD5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC78A2IDD5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC78A2IDD5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC78A2IDD5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC78A2IDD5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC78A2IDD5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC78A2IDD5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC78A2IDD5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC78A2IDD5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC78A2IDD5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC78A2IDD5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC78A2IDD5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC78A2IDD5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC78A2IDD5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC78A2IDD5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC78A2IDD5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC78A2IDD5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC78A2IDD5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC78A2IDD5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC78A2IDD5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC78A2IDD5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC78A2IDD5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC78A2IDD5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC78A2IDD5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC78A2IDD5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC78A2IDD5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC78A2IDD5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC78A2IDD5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC78A2IDD5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC78A2IDD5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC78A2IDD5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC78A2IDD5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC78A2IDD5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC78A2IDD5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC78A2IDD5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC78A2IDD5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC78A2IDD5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC78A2IDD5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC78A2IDD5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC78A2IDD5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC78A2IDD5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC78A2IDD5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC78A2IDD5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC78A2IDD5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC78A2IDD5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CCDC78A2IDD5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC78A2IDD5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC78A2IDD5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC78A2IDD5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CCDC78A2IDD5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC78A2IDD5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC78A2IDD5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC78A2IDD5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC78A2IDD5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC78A2IDD5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC78A2IDD5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC78A2IDD5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC78A2IDD5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC78A2IDD5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC78A2IDD5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC78A2IDD5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC78A2IDD5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC78A2IDD5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC78A2IDD5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC78A2IDD5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC78A2IDD5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC78A2IDD5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC78A2IDD5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC78A2IDD5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC78A2IDD5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC78A2IDD5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC78A2IDD5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC78A2IDD5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC78A2IDD5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC78A2IDD5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC78A2IDD5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC78A2IDD5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC78A2IDD5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC78A2IDD5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC78A2IDD5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC78A2IDD5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC78A2IDD5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC78A2IDD5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC78A2IDD5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC78A2IDD5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC78A2IDD5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC78A2IDD5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC78A2IDD5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC78A2IDD5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC78A2IDD5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC78A2IDD5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC78A2IDD5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms