Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 MYOCD-201ENST00000343344 2817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 SERPINA11-201ENST00000334708 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 STK33-201ENST00000315204 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 LRRC2-AS1-201ENST00000599511 2291 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 OR52K1-202ENST00000641528 5456 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 PPHLN1-202ENST00000317560 1359 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 ARHGAP20-203ENST00000527598 5998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 OR51A10P-201ENST00000307165 937 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 SNORD46-201ENST00000364043 104 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AC090114.1-201ENST00000393266 448 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 SNRPD3-202ENST00000402849 567 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AL117344.1-201ENST00000407196 616 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AC235097.1-201ENST00000412163 681 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AL161742.1-201ENST00000418154 584 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 EEF1A1P27-201ENST00000429983 1135 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AL355483.3-201ENST00000446686 752 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 FREM2-AS1-201ENST00000448887 465 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 ANK3-213ENST00000486349 493 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 ABHD10-204ENST00000494817 801 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AC008496.1-201ENST00000509131 295 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AC008417.1-201ENST00000510014 565 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AC025524.2-202ENST00000523042 535 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AP001922.2-201ENST00000530435 390 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 CCDC60-204ENST00000539847 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AC005833.3-202ENST00000544741 770 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 BMS1P15-201ENST00000554269 1141 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 C14orf2-209ENST00000554880 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 GNG2-215ENST00000557376 573 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AC092368.2-201ENST00000565911 600 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 RPL17-208ENST00000580261 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 SSX2B-202ENST00000596480 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AC023206.1-201ENST00000605824 298 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AL049541.1-201ENST00000630976 642 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AL590396.3-201ENST00000636334 300 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AC087269.2-201ENST00000641764 975 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 WDR64-204ENST00000437684 2310 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 C7orf31-202ENST00000409280 3357 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 TXNIP-204ENST00000582401 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 ASCC1-201ENST00000317126 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 LSM8-204ENST00000424702 4030 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 LY75-201ENST00000263636 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 CS-201ENST00000351328 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 STN1-202ENST00000369764 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 LIMA1-216ENST00000552909 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 OR2T6-202ENST00000641644 4670 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 HSPD1P1-201ENST00000503199 1726 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 TIAL1-203ENST00000369093 5072 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 HSPA8P11-201ENST00000508840 1898 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 MUC4-209ENST00000463781 17110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 MIR17HG-202ENST00000581816 2032 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 ARID5B-201ENST00000279873 7891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 U3.14-201ENST00000365363 227 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 CASP10-206ENST00000374650 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 SERPINB12-202ENST00000382768 1278 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 TRBV19-201ENST00000390393 552 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AC097713.1-201ENST00000418025 562 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 GAPDHP51-201ENST00000426454 1000 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 LINC01522-201ENST00000428999 429 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AL731892.1-201ENST00000437364 1192 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AL138930.1-201ENST00000446952 635 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AC009411.2-201ENST00000458359 539 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 RN7SL180P-201ENST00000466769 294 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 MRPS33-203ENST00000467334 622 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AC040975.1-201ENST00000472104 316 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 DPH5-211ENST00000488176 1034 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 TECRP2-201ENST00000503270 928 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 LNX1-AS2-202ENST00000509974 628 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AC022784.1-201ENST00000512942 699 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
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