Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 GDNF-202ENST00000344622 3655 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 KLHL32-202ENST00000369261 3698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 AL022068.1-201ENST00000636202 1875 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 PLEKHM3-202ENST00000427836 9807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 COQ10B-202ENST00000409010 1355 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 PPFIBP1-207ENST00000537927 5719 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 AF131216.1-201ENST00000498997 5856 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 RRM2-201ENST00000304567 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 ADH4-212ENST00000629236 1974 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 DLG2-229ENST00000531015 2892 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 MAPK10-357ENST00000641831 2858 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 ABL2-201ENST00000344730 6910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 ACSL5-201ENST00000354273 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 MCTS1-202ENST00000371317 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 RPL5P8-201ENST00000396820 815 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 CNTN4-201ENST00000397459 2322 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 AL353651.1-201ENST00000415629 355 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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HOXD10P28358 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
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HOXD10P28358 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 AL355607.1-201ENST00000427745 295 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 AL513304.1-201ENST00000432987 359 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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HOXD10P28358 MAGEC3-203ENST00000443323 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 AL391422.2-202ENST00000454396 347 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 LINC01706-201ENST00000455299 748 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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HOXD10P28358 C14orf119-202ENST00000554203 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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HOXD10P28358 AC013652.1-204ENST00000558209 489 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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HOXD10P28358 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
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HOXD10P28358 AC010605.1-201ENST00000597303 797 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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HOXD10P28358 GTF2E1-201ENST00000283875 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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HOXD10P28358 GTF2H1-201ENST00000265963 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
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HOXD10P28358 AC067817.2-201ENST00000459965 387 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
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HOXD10P28358 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 SETP17-201ENST00000534163 817 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 AC124891.1-201ENST00000536322 519 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 EEF1A1P17-201ENST00000547505 1275 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 RN7SL199P-201ENST00000578752 281 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 RN7SL656P-201ENST00000579044 281 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 RN7SL270P-201ENST00000579643 281 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 Metazoa_SRP.202-201ENST00000585071 281 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 5S_rRNA.23-201ENST00000612086 102 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 PPP3CB-AS1-215ENST00000620559 656 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 AC127071.1-201ENST00000624997 712 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 SATB1-AS1-242ENST00000627496 807 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 CASC19-212ENST00000641153 1287 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD10P28358 ANKS1B-215ENST00000549493 3328 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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