Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 LINC01606-205ENST00000519314 562 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 CTHRC1-203ENST00000520337 1198 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC090458.1-202ENST00000530387 462 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC006581.1-201ENST00000545706 496 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 LACRT-203ENST00000547511 504 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC013457.1-201ENST00000556770 1011 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 DTNA-220ENST00000590831 847 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC093503.1-202ENST00000598743 478 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC068802.1-201ENST00000603420 732 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AL390037.1-201ENST00000610918 431 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC103974.2-201ENST00000611319 778 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 FAM184A-213ENST00000617072 1251 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC245028.3-201ENST00000618197 285 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AL109954.1-201ENST00000619495 557 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 NPPA-AS1_1.1-201ENST00000622391 173 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC026950.2-201ENST00000633456 470 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 MUC4-209ENST00000463781 17110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 UBR1-202ENST00000546274 3332 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 TMBIM6-209ENST00000547798 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 ATP2B4-204ENST00000367218 8918 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 FHL5-203ENST00000541107 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC091940.1-204ENST00000507318 3091 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 CNOT4-201ENST00000315544 3783 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 RALBP1-206ENST00000609094 3676 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 NBPF14-201ENST00000581201 2931 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 NBPF26-206ENST00000617913 2931 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 MORF4L2-208ENST00000441076 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 HTT-201ENST00000355072 13474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 ZNF438-208ENST00000538351 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 NUP210L-202ENST00000368553 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 ZNF438-203ENST00000375311 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 NRXN1-206ENST00000402717 2508 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 EEF1A1P28-201ENST00000450915 1403 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 FADS2P1-201ENST00000611807 1446 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 OPRM1-205ENST00000414028 2485 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 MEIS1-202ENST00000398506 3530 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 SLC7A6-209ENST00000566454 6308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 KCNMA1-266ENST00000639601 11920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 OR2V2-203ENST00000641791 4428 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 SLC7A6-216ENST00000618043 6124 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 CU633906.1-201ENST00000621924 2380 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 COPS4-209ENST00000511653 1695 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 FAM49A-201ENST00000381323 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 UBAP2-201ENST00000360802 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 SGCD-202ENST00000435422 9755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 PNN-201ENST00000216832 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 ZNF257-203ENST00000594947 3874 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AKAP13-203ENST00000394518 13215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 FHL1-204ENST00000370683 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 KCNIP2-202ENST00000343195 663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 RN7SKP76-201ENST00000364419 323 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AL450313.1-201ENST00000366376 452 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 SMCP-201ENST00000368765 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 PHACTR1-204ENST00000379348 795 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 TXNDC9-202ENST00000409434 1111 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AL358779.1-201ENST00000415465 400 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 RPS6KA2-IT1-201ENST00000416770 579 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC093580.1-201ENST00000420549 671 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 RPL23AP34-201ENST00000423483 410 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 SCP2-207ENST00000435345 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 LINC00578-201ENST00000439009 542 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AL021939.1-201ENST00000441868 886 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 RPL6P24-201ENST00000445338 864 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 RPL7L1P11-201ENST00000446092 721 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC099786.1-201ENST00000446238 670 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 NEURL1-AS1-201ENST00000447820 439 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 RBM22P5-201ENST00000449536 1277 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 KDM4A-AS1-205ENST00000453015 647 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 RN7SL791P-201ENST00000467868 295 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 BX890604.1-206ENST00000471090 922 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
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