Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AL513218.1-201ENST00000606527 391 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 LRMDA-216ENST00000611306 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 MIR6762-201ENST00000613340 86 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 MIR6732-201ENST00000619365 60 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 OFCC1-218ENST00000622909 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AL513321.2-202ENST00000634479 921 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AP000688.2-201ENST00000422473 2336 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 FBLN5-205ENST00000556154 1875 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 DEPDC1B-201ENST00000265036 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 NAA15-208ENST00000515576 2456 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 RNASE9-209ENST00000557068 2703 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 MTMR8-201ENST00000374852 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 SNTN-203ENST00000496807 3746 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 RNASEL-201ENST00000367559 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 OR5T2-202ENST00000641661 2062 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 MAPK10-365ENST00000641902 3825 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 COX7B-203ENST00000481445 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 DCLRE1C-211ENST00000396817 2761 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 LCP1-202ENST00000398576 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 OR2G6-201ENST00000343414 1049 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 CTSL3P-201ENST00000354530 657 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 OR10A3-201ENST00000360759 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 IGLV5-52-201ENST00000390289 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 TRBV19-201ENST00000390393 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 CFAP70-204ENST00000394865 1222 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 LINC00362-201ENST00000414345 264 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 LINC01704-201ENST00000414848 834 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 MTND6P1-201ENST00000417434 424 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AC023141.1-201ENST00000419418 379 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 OR1M1-201ENST00000429566 1035 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AC105393.2-201ENST00000431911 549 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AL035691.1-201ENST00000434562 595 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 FREM2-AS1-201ENST00000448887 465 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AC004692.1-201ENST00000455430 424 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AC009411.2-201ENST00000458359 539 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 RN7SL392P-201ENST00000473024 299 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 RN7SL775P-201ENST00000498361 336 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AC110760.2-202ENST00000507517 946 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AC016559.1-201ENST00000511420 199 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AC117383.2-201ENST00000514722 322 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
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RTL8BQ17RB0 AC010247.1-201ENST00000527895 759 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 FAM192A-206ENST00000564108 1055 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AC096708.2-201ENST00000577676 512 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 MIR4262-201ENST00000578394 54 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AC061975.3-201ENST00000583209 244 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 STARD13-AS-232ENST00000609137 882 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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RTL8BQ17RB0 AC073862.4-201ENST00000622982 854 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
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RTL8BQ17RB0 OR7E161P-202ENST00000641994 1033 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 MAPK10-344ENST00000641718 3746 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AC011592.1-201ENST00000624647 3634 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 CYP4Z2P-202ENST00000505841 1436 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AC127024.8-201ENST00000623719 2094 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 KCNMB3P1-202ENST00000493696 3389 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 ACAA2-206ENST00000589432 1840 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 GPR1-203ENST00000437420 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
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RTL8BQ17RB0 RGS7-201ENST00000348120 1980 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 LRRC31-201ENST00000264676 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
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RTL8BQ17RB0 ALDH1A1-201ENST00000297785 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 ACOT13-201ENST00000230048 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 ZNF559-ZNF177-203ENST00000541595 2435 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 SLC2A14-201ENST00000340749 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 DDX43P1-201ENST00000510713 1763 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 OLR1-201ENST00000309539 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 HMGN2P46-204ENST00000409454 1923 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 RBPJ-214ENST00000507561 1689 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 USP1-202ENST00000371146 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 ADH4-212ENST00000629236 1974 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AL138847.1-201ENST00000258651 546 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 RPL12P13-201ENST00000310055 497 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 TPPP2-201ENST00000321760 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 SNORA30B-201ENST00000365319 129 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AC096570.1-201ENST00000419013 569 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 LINC01980-202ENST00000425195 491 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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