Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC116353.1-201ENST00000489727 316 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC025180.1-201ENST00000505701 595 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 INTS9-AS1-201ENST00000520055 548 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC022973.3-201ENST00000521014 467 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 ZNF345-205ENST00000526123 458 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC090589.2-201ENST00000532022 332 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 SETP17-201ENST00000534163 817 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 WASF2-201ENST00000536657 1083 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 TMEM132D-AS1-204ENST00000537367 531 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC138123.2-204ENST00000547432 721 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 LINC02318-202ENST00000556346 715 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AL162511.1-201ENST00000556542 879 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 OR11J5P-201ENST00000556889 934 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC009119.1-204ENST00000561599 564 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC063923.2-201ENST00000562158 928 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 DNM1P34-202ENST00000567850 315 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC040162.2-201ENST00000573092 157 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 WDR45BP1-201ENST00000583470 1029 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC008770.1-206ENST00000589551 523 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 OR7A18P-201ENST00000600416 277 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC138035.1-203ENST00000604354 1066 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AL596325.2-201ENST00000609669 505 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 MIR6726-201ENST00000613751 61 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 BCL2L11-224ENST00000639340 243 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 SLC15A2-205ENST00000489711 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC067968.1-201ENST00000591793 3766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 C11orf88-203ENST00000529167 3099 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 GNE-205ENST00000539815 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 C3orf30-201ENST00000295622 1814 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 TNFRSF19-203ENST00000382263 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 KPNB1-203ENST00000540627 2989 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 KAT6B-202ENST00000372711 7560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 CXCR6-202ENST00000438735 2242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 WDR44-202ENST00000371822 3877 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 TSHZ2-203ENST00000603338 3803 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 ABLIM3-201ENST00000309868 4326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 CNTNAP4-206ENST00000478060 3708 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC018992.1-201ENST00000523778 2149 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 PIWIL4-201ENST00000299001 3199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 NPIPB11-201ENST00000524087 3653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 RBM41-202ENST00000372487 2579 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 EIF4E2-207ENST00000409514 3525 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 MMP20-201ENST00000260228 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 MPEG1-201ENST00000361050 4442 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 IPO5-222ENST00000490680 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 SLC12A6-201ENST00000290209 7286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 LINC00559-201ENST00000569476 3867 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 CFI-205ENST00000512148 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 ADGRE4P-202ENST00000600751 2810 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 CDH12-201ENST00000382254 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 KIAA1210-201ENST00000402510 7824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 ABLIM1-214ENST00000533213 7606 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 ACPP-201ENST00000336375 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 SOX6-211ENST00000528429 2656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 UMAD1-206ENST00000636849 2157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 LINC01653-201ENST00000456026 1728 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 CST13P-201ENST00000376992 428 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 IL6-202ENST00000401630 765 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 IGLC6-201ENST00000410078 317 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 RN7SKP39-201ENST00000410773 322 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 GSTA10P-201ENST00000412182 576 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 RPL12P27-201ENST00000414870 496 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 FDPSP8-201ENST00000438304 1089 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 OR13C1P-201ENST00000457612 963 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC111198.1-201ENST00000505575 606 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC117422.1-201ENST00000508263 379 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC139713.1-202ENST00000512366 460 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 LINC02150-201ENST00000513157 2120 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 NTAN1P2-201ENST00000515730 940 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 LACTB2-AS1-204ENST00000519167 793 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms