Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 TEX11-204ENST00000395889 3133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 MED6-212ENST00000615788 1700 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 KIAA1524-207ENST00000619684 2839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 SPARCL1-201ENST00000282470 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 MAMDC2-AS1-202ENST00000414515 2097 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 SERPINB8-208ENST00000542677 3192 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 VTCN1-201ENST00000328189 2289 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 EPHA3-201ENST00000336596 5809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 GUCY2C-201ENST00000261170 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 PLGLB2-201ENST00000359481 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 NPL-202ENST00000367552 745 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 IGLV5-52-201ENST00000390289 379 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 DNASE1L3-201ENST00000394549 1294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 NPPA-AS1-201ENST00000400892 936 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 IGBP1-AS2-201ENST00000403371 513 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 AC004870.2-202ENST00000423781 706 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 LINC00462-201ENST00000425350 962 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 AL138479.1-201ENST00000426913 484 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 AC092646.1-201ENST00000427142 901 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 SNORA81.1-201ENST00000458922 177 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 AC096741.2-201ENST00000510225 637 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 RPS23-208ENST00000512493 443 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 RPS20-202ENST00000518875 671 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 OXR1-212ENST00000521592 993 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 AC010247.1-201ENST00000527895 759 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 NDUFA3P2-201ENST00000531434 232 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 AL049844.1-201ENST00000545614 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 AC009955.2-201ENST00000597288 542 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 Metazoa_SRP.57-201ENST00000597717 283 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 AC092032.1-201ENST00000603090 165 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 AC068802.1-201ENST00000603420 732 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 AL353572.3-201ENST00000636536 670 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 LEKR1-201ENST00000356539 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 MTMR8-201ENST00000374852 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 EEF1A1P20-201ENST00000514852 1386 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 AL390726.6-202ENST00000635962 1365 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 CEACAM20-205ENST00000620096 1494 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 EPHA3-203ENST00000494014 3085 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 OR4C1P-202ENST00000641065 1569 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 ZNF3-203ENST00000303915 3473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 SEC31A-207ENST00000443462 4042 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 PTK2-228ENST00000521059 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 NAA15-208ENST00000515576 2456 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 AP000866.1-202ENST00000529392 2792 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 NT5C2-203ENST00000404739 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 YOD1-202ENST00000367084 6291 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 PAPOLG-201ENST00000238714 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 SLC25A40-201ENST00000341119 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 TMEM59-204ENST00000371344 2473 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 TRAV38-1-201ENST00000390464 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 FBXO7-202ENST00000397426 1888 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 RBBP4P4-201ENST00000398588 1289 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 AL121949.2-201ENST00000403446 1548 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 TPTE2P2-201ENST00000403471 1466 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 XPO1-202ENST00000404992 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 RN7SKP254-201ENST00000410685 310 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 RN7SKP137-201ENST00000411074 307 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 NRIR-202ENST00000414795 506 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 SMARCA2-211ENST00000417599 980 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 AL445193.2-201ENST00000419596 620 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 AL121983.2-201ENST00000426899 688 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 CASC6-201ENST00000437768 733 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 LINC00570-203ENST00000437795 490 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 AL022157.1-201ENST00000439622 665 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 AC027124.1-201ENST00000440852 466 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 AC067817.2-201ENST00000459965 387 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 AC091982.1-202ENST00000473923 343 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 NDFIP2-203ENST00000487865 1384 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 AC055758.2-201ENST00000495382 799 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 ARHGEF3-214ENST00000497267 2197 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 RNA5SP518-201ENST00000515957 119 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVS71-1P61550 C5orf58-205ENST00000524171 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.6 ms