Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 AC100823.1-201ENST00000442274 480 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 LINC00265-202ENST00000448955 468 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 COX7A2L-204ENST00000463055 540 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 RN7SL223P-201ENST00000470401 294 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 RN7SL685P-201ENST00000476271 298 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AC105910.1-201ENST00000482585 483 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 RN7SL862P-201ENST00000491550 298 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AC008799.1-201ENST00000495909 457 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 LINC01411-204ENST00000510234 938 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AC097494.1-201ENST00000512898 732 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 LINC02200-203ENST00000513687 541 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AC107220.1-201ENST00000514347 1037 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 SNORA70.23-201ENST00000517218 151 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 IGKV2OR22-4-201ENST00000523309 367 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AF279873.3-204ENST00000523336 784 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 CCNC-215ENST00000523799 1035 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 CRYAB-203ENST00000525823 915 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AC104031.1-201ENST00000527726 372 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 ZNF585B-204ENST00000531805 2971 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 RASSF8-AS1-204ENST00000535436 1121 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AC084816.1-211ENST00000540994 485 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 RBM7-208ENST00000545678 867 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AC022165.1-201ENST00000568771 596 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AP001025.3-201ENST00000578787 864 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AC010327.2-201ENST00000587647 488 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AC003002.3-201ENST00000597410 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 VDAC1P5-201ENST00000603132 844 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 SNX29P2-204ENST00000603801 875 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 RBM22P6-201ENST00000611682 867 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AC084876.1-201ENST00000612793 641 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 MIR6872-201ENST00000612981 62 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 pRNA.12-201ENST00000614353 90 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 pRNA.3-201ENST00000615048 90 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 BMS1P14-201ENST00000615056 606 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 RN7SL301P-202ENST00000618767 298 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 WDR11-AS1-207ENST00000630905 769 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AC068205.4-201ENST00000637880 804 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 CFHR5-201ENST00000256785 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 METTL8-201ENST00000375258 8203 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 A2M-201ENST00000318602 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 KLHL8-202ENST00000425278 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 CCDC93-201ENST00000319432 6896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 CCDC93-202ENST00000376300 6899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 TENM4-201ENST00000278550 14000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 SUPT20H-224ENST00000542180 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 ZNF229-204ENST00000614049 4507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 NANOG-201ENST00000229307 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 PHLPP2-201ENST00000393524 8467 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 ATP9B-208ENST00000586722 1650 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 COMMD6-205ENST00000406936 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AL359694.2-201ENST00000567753 1615 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 TFRC-203ENST00000420415 4814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 GAGE1-204ENST00000619375 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 ZNF174-203ENST00000571936 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 GRIA4-206ENST00000525187 2822 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 ST7-206ENST00000393447 2182 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 MAP4-209ENST00000434267 2772 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 ZNF181-204ENST00000492450 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 ADGRL3-209ENST00000508693 5009 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 OR2V2-203ENST00000641791 4428 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 CASK-204ENST00000378166 3123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 FBXO38-201ENST00000296701 3680 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AMOT-202ENST00000371958 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 HESX1-201ENST00000295934 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 RPS7-201ENST00000304921 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 PPIH-201ENST00000304979 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 RNU4-59P-201ENST00000364447 116 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 RIT1-201ENST00000368322 855 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 CCNYL3-201ENST00000407030 998 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AC004009.1-201ENST00000412413 567 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 RCAN3-203ENST00000412742 667 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms