Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AL050343.1-203ENST00000586761 1290 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 AC063962.1-201ENST00000608199 521 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 AC087072.2-201ENST00000621060 682 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 AL009031.1-201ENST00000632346 1026 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 MAGT1-204ENST00000610432 4019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 AL390726.6-202ENST00000635962 1365 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 FAM111B-201ENST00000343597 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 ARID5B-201ENST00000279873 7891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 RNF14-204ENST00000394519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 LINC02547-201ENST00000531559 3308 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 EPS15P1-202ENST00000459691 2071 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 NPIPB13-201ENST00000520915 3584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 NEK2P4-201ENST00000425793 1329 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 AL512310.3-201ENST00000547023 1335 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 DCP1B-205ENST00000540622 1547 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 AC013562.1-201ENST00000519427 1722 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 MEPE-203ENST00000424957 2022 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 RNASE9-209ENST00000557068 2703 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 SCN9A-202ENST00000409435 5967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 LEKR1-204ENST00000470811 2881 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 TPTE2P2-201ENST00000403471 1466 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 ARL4A-201ENST00000356797 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 ARMCX7P-201ENST00000372828 562 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 IFNA16-201ENST00000380216 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 AC006547.2-201ENST00000412713 526 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 AC109638.1-201ENST00000417406 326 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 LIX1L-AS1-203ENST00000421764 287 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 FDPSP8-201ENST00000438304 1089 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 NEURL1-AS1-201ENST00000447820 439 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 AC018892.2-201ENST00000457656 693 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 AC016489.1-201ENST00000461109 375 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 RN7SL688P-201ENST00000471754 275 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 EIF3KP1-201ENST00000513279 656 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 EGLN3P1-201ENST00000541727 720 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 AC092375.1-201ENST00000550410 637 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 AC013489.1-201ENST00000561140 598 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 AC091178.1-204ENST00000577328 366 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 AC006262.2-201ENST00000599127 612 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 IL13-206ENST00000617259 498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 PART1_3.1-201ENST00000619680 131 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 AL392046.2-202ENST00000635301 1113 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 ARHGAP21-201ENST00000320481 4343 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 OR7C1-205ENST00000642030 11778 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 AC011592.1-201ENST00000624647 3634 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 SLC3A1-206ENST00000409740 1418 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 ELMO1-202ENST00000396040 1982 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 RRS1-AS1-201ENST00000499642 4366 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 PDE4D-210ENST00000503258 2860 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 SERPINA11-201ENST00000334708 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 ELOC-205ENST00000520210 1451 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 RNU6-1017P-201ENST00000363613 106 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 RNA5SP396-201ENST00000364834 120 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 ALOX5AP-201ENST00000380490 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 SNORA70.8-201ENST00000384231 136 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 VN1R66P-201ENST00000412929 916 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 AL596451.1-201ENST00000419824 572 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 OR7E117P-201ENST00000422682 1112 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 GAPDHP55-201ENST00000423136 803 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 AC079781.1-201ENST00000441505 394 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 LINC02556-201ENST00000450776 346 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 AL355472.1-201ENST00000451795 575 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 AL592464.2-201ENST00000457440 607 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 RN7SL152P-201ENST00000484176 298 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 RN7SL647P-201ENST00000485429 300 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 RN7SKP64-201ENST00000517206 328 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 KLRD1-210ENST00000543777 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 RNASE11-206ENST00000553849 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 AC009063.2-201ENST00000563981 906 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 RPS7P1-201ENST00000571702 585 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PDK4Q16654 LINC01028-201ENST00000586373 1045 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms