Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AL355516.1-201ENST00000422082 746 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AL445524.1-205ENST00000425412 392 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AL590729.1-201ENST00000427046 573 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 HMGA1P4-201ENST00000428643 334 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AL022721.1-201ENST00000436521 505 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 WDR64-204ENST00000437684 2310 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC097358.1-201ENST00000438827 582 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC084809.2-201ENST00000444464 512 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC093157.1-205ENST00000449473 1298 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 LINC01431-203ENST00000452395 505 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AL135908.1-202ENST00000454135 562 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 ZNF33A-204ENST00000458705 6084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 ZBTB20-AS4-201ENST00000472323 675 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 LINC02200-203ENST00000513687 541 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 CEP57L1-214ENST00000521277 3832 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC022679.2-201ENST00000522186 813 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AP001782.1-202ENST00000527774 445 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 PLA2G7-202ENST00000537365 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AL049870.3-201ENST00000555157 360 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 MMP25-AS1-206ENST00000573130 4434 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 PRELID3BP3-201ENST00000584963 545 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC139795.3-201ENST00000606358 541 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC012640.3-201ENST00000607847 430 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 STX18-AS1-206ENST00000608184 3047 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AL133351.5-201ENST00000612789 106 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 MID1-212ENST00000616003 1926 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC007224.2-201ENST00000625011 510 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 SPRR5-201ENST00000636302 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC087885.1-201ENST00000641910 848 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 KLHL8-203ENST00000498875 5175 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 ZEB2-227ENST00000627532 9541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 NBPF15-206ENST00000581897 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 HLF-210ENST00000575345 3589 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 ABI1-202ENST00000359188 3492 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 MYOF-202ENST00000359263 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 ATM-201ENST00000278616 13147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 MTFR1L-207ENST00000466284 3262 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 MAPK10-298ENST00000641297 3040 ntAPPRIS P2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 LINC01204-203ENST00000609127 2900 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 HCG18-244ENST00000602516 2890 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 SULT1C2-202ENST00000326853 2828 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC061975.7-201ENST00000592016 2692 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 UBE2V2-207ENST00000523111 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 SMG1P1-202ENST00000309865 4223 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 TNRC6A-201ENST00000315183 8303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 SGK1-223ENST00000528577 1850 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 RFX5-201ENST00000290524 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 CENPL-203ENST00000367710 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 CD46-201ENST00000322875 3278 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 CD46-207ENST00000367041 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 GLYATL2-201ENST00000287275 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC092701.1-201ENST00000623627 1551 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 PTK2-207ENST00000517887 4661 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 TMEM267-202ENST00000500337 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 NASP-203ENST00000372052 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 PRKCA-202ENST00000413366 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 USP32P2-201ENST00000412260 4329 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 MAPK10-244ENST00000639972 2818 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 EEF1A1P3-201ENST00000417549 1385 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 OR4D6-201ENST00000300127 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 LST1-211ENST00000376110 433 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 TRBV5-3-201ENST00000390362 343 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 OLA1P1-201ENST00000396387 1189 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 ELOBP4-201ENST00000423418 296 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 RPL19P21-201ENST00000424919 591 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 PAICSP1-201ENST00000425324 1217 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 WWC3-AS1-201ENST00000430057 578 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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