Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AC129807.1-201ENST00000471614 591 ntTSL 4 BASIC8.06□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 AC146944.3-201ENST00000509969 371 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 OR4A1P-201ENST00000532342 920 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 OPCML-IT2-201ENST00000533260 398 ntTSL 4 BASIC8.06□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 OR11H12-201ENST00000550708 1085 ntAPPRIS P1 BASIC8.06□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 AP002345.2-201ENST00000609961 904 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 DST-207ENST00000421834 18030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 RGS7-201ENST00000348120 1980 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 SORL1-212ENST00000534286 3501 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 CHURC1-203ENST00000549115 2629 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 BRINP3-201ENST00000367462 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 MYOM1-201ENST00000261606 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 IRAK4-214ENST00000613694 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 ELP4-229ENST00000640961 8164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 ZNF770-201ENST00000356321 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 POLR3A-201ENST00000372371 6640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 ATP2B1-204ENST00000428670 7032 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 THAP9-201ENST00000302236 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 NFRKB-203ENST00000524794 4351 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 PDE4DIP-205ENST00000369354 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 ZNF211-202ENST00000254182 1959 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 NUDT4-206ENST00000549992 3607 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 FRMPD2-201ENST00000305531 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 RBM11-201ENST00000400577 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 HSP90AB7P-201ENST00000450068 2454 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 TTC28-208ENST00000612946 11274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 NSA2-205ENST00000610426 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 EPHA4-203ENST00000409938 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 LNPEP-202ENST00000395770 3888 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 NXPE2P1-201ENST00000543705 726 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 ZNF544-216ENST00000600044 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC8.05□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 DDX10-203ENST00000526794 6707 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 SIRPB1-205ENST00000381605 3241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 MAGEB16-202ENST00000399987 1736 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 KARSP2-201ENST00000415696 1639 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 ARPP21-220ENST00000441454 2880 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 SORBS2-209ENST00000418609 5529 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 PARP4-201ENST00000381989 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 NCKAP5-201ENST00000317721 7593 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 NCKAP5-205ENST00000409261 7594 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 AP000866.1-202ENST00000529392 2792 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 MAP4K4-212ENST00000456652 3855 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 GCNT2-216ENST00000495262 2214 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 OVCH1-201ENST00000318184 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 HABP2-203ENST00000542051 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 PSG5-202ENST00000366175 1766 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 AP002001.1-202ENST00000525797 1754 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 OR2T1-202ENST00000642005 2104 ntAPPRIS P1 BASIC8.05□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 ZC3H8-202ENST00000409573 5965 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 MED6-212ENST00000615788 1700 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 PPIAP26-201ENST00000377951 522 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 SMIM2-201ENST00000400419 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 LINC00433-201ENST00000424165 888 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 FGF13-AS1-201ENST00000438238 849 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 RPL26P30-201ENST00000453533 435 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 EBF2-204ENST00000535548 1017 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC8.04□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 AL035422.2-201ENST00000603059 565 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 AC090771.1-201ENST00000585803 1618 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 AC132219.2-201ENST00000624416 2327 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 AL355488.1-201ENST00000449169 2611 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 ARHGEF9-222ENST00000636048 5059 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 TCF4-203ENST00000398339 2551 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 OR4F17-203ENST00000618231 2586 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 UBN1-208ENST00000590769 3530 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 PPP2R2B-202ENST00000394409 10704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 MSH6-209ENST00000538136 4055 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 SUPT6H-202ENST00000347486 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 FAM13A-202ENST00000395002 4945 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 HBS1L-206ENST00000415177 2636 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 DROSHA-220ENST00000513349 4681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 LRP2BP-201ENST00000328559 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 TDRKH-201ENST00000368822 3093 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 SORBS1-204ENST00000361941 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
POLR2AP24928 CDC40-203ENST00000368932 3933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms