Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 AC117395.3-201ENST00000471176 680 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AC009022.1-201ENST00000472115 496 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 QTRT2-212ENST00000485050 3844 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 GGTA1P-204ENST00000488429 1104 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 RPL34P29-201ENST00000491411 325 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 RN7SL864P-201ENST00000493457 285 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AC079795.1-201ENST00000508847 358 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 KRT18P54-201ENST00000513396 748 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 RNU7-179P-201ENST00000516608 68 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 IGHVII-22-1-201ENST00000517888 265 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 IGHVII-78-1-201ENST00000521105 269 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 MIR2052HG-204ENST00000523442 550 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 PPP1R1AP1-201ENST00000525622 425 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AP002957.1-201ENST00000525952 406 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 SLC22A10-203ENST00000526800 699 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 OR4A1P-201ENST00000532342 920 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AC117498.2-202ENST00000549864 473 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AC138123.3-201ENST00000551928 791 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AL357093.2-202ENST00000556942 498 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 LINC01588-213ENST00000557142 492 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AC009121.2-201ENST00000572913 714 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AC061975.4-201ENST00000578466 776 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 ADGRF5P1-202ENST00000590130 980 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AL358394.3-202ENST00000599308 832 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AC010519.1-201ENST00000599924 344 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 BNIP3P17-201ENST00000605448 595 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AL390037.1-201ENST00000610918 431 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 Metazoa_SRP.20-201ENST00000619896 275 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AC012100.3-201ENST00000624738 575 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AP000356.4-201ENST00000639500 172 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 STRADA-246ENST00000640397 1045 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 FBXW2-205ENST00000608872 9138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 LDHB-201ENST00000350669 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 GLRX-202ENST00000379979 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 OR2T33-202ENST00000641220 4118 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 SENP8-201ENST00000340912 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 MITF-201ENST00000314557 1798 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 SP110-203ENST00000358662 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 MRPS17P1-201ENST00000596009 3130 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 LINC01427-202ENST00000635258 4566 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 ZNF106-201ENST00000263805 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 NFAT5-201ENST00000349945 13362 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 SLC24A1-209ENST00000537259 3983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 TRIM2-203ENST00000437508 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 SALL1P1-201ENST00000438101 3837 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 GLI1-201ENST00000228682 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 APOL3-203ENST00000397287 3626 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 TRIM6-202ENST00000380097 3403 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 KCNA2-208ENST00000638616 3279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 INSIG2-201ENST00000245787 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 DUXAP8-203ENST00000437781 2398 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 ERLIN2-211ENST00000523887 2347 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 LRRC2-AS1-201ENST00000599511 2291 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 STX2-203ENST00000392373 2151 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AC092999.1-201ENST00000624004 1924 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AC007614.2-201ENST00000569877 1851 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 DYNC1I2P1-201ENST00000435916 1838 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 GLYAT-202ENST00000344743 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 PLCE1-AS2-202ENST00000432782 1612 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 UGT2B7-205ENST00000622664 1532 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 FMO10P-201ENST00000455032 1493 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 FKBP15-201ENST00000238256 4336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AMTN-201ENST00000339336 1037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 MOSPD1-201ENST00000370777 784 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 ST3GAL3-213ENST00000372365 673 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 RFKP1-201ENST00000400940 428 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AC008937.2-201ENST00000415589 619 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 RPL36P1-201ENST00000419720 225 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AP000317.1-201ENST00000427022 805 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 CICP10-201ENST00000439497 198 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
DKK2Q9UBU2 ACTP1-201ENST00000440793 383 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.7 ms