Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 TATDN2P3-201ENST00000452855 3665 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 KIAA1549L-201ENST00000265654 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 ZCWPW2-201ENST00000383768 1716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 TAS2R7-201ENST00000240687 1096 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 RPL10P16-201ENST00000325000 645 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 RN7SKP107-201ENST00000364157 290 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 SNORA51.7-201ENST00000384171 134 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 OR7E91P-201ENST00000400027 866 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 AL591368.1-202ENST00000413050 548 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 RPSA-202ENST00000443003 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 GTF2F2P2-201ENST00000445825 721 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 PMS2P11-201ENST00000451831 574 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 ZNF32-AS1-201ENST00000453284 434 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 AP005202.1-201ENST00000489915 867 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 FTH1P8-201ENST00000498161 514 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 LECT2-203ENST00000512872 762 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 AC117383.2-201ENST00000514722 322 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 AL591767.3-201ENST00000554632 525 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 COX6CP11-201ENST00000555293 229 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 AC092868.2-201ENST00000558749 497 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 PDCD6IPP2-205ENST00000565892 498 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 AC087575.1-201ENST00000585087 229 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 AC011447.3-202ENST00000593655 555 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 AC104184.1-201ENST00000607513 721 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 AC083964.1-201ENST00000607549 630 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 FAM27E3-202ENST00000614611 340 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 AC005785.2-201ENST00000624655 631 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 AC009812.3-201ENST00000523871 3766 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 CABYR-216ENST00000621648 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 PROX1-AS1-202ENST00000433082 5266 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 MUSK-205ENST00000374448 2754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 OLR1-201ENST00000309539 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 AC130456.1-201ENST00000565085 1363 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 AL137918.1-201ENST00000624542 1922 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 PRND-201ENST00000305817 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 AL049647.1-201ENST00000319682 1789 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 YOD1-202ENST00000367084 6291 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 AP005139.1-201ENST00000580702 1647 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 AC121761.1-201ENST00000547326 1482 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 FBLN5-205ENST00000556154 1875 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 CS-212ENST00000548567 3057 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 EPB41L2-209ENST00000525193 2121 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 ECI2-204ENST00000380125 1405 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 AL365204.1-201ENST00000423440 1430 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 SNTN-203ENST00000496807 3746 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 NRCAM-203ENST00000379024 5782 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 RERGL-201ENST00000229002 1147 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 RNA5SP301-201ENST00000362537 121 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 RNU1-38P-201ENST00000362817 144 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 AL390760.1-201ENST00000366188 410 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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PDK4Q16654 AC007091.1-201ENST00000412563 566 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 PPIAP30-201ENST00000415473 519 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 PMS2P3-203ENST00000422064 567 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 GYG1P2-201ENST00000426437 1006 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 LINC01732-201ENST00000435023 542 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 AC091730.1-201ENST00000440455 692 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 AL033379.1-201ENST00000442184 481 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 AL136528.1-201ENST00000443034 754 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 LAPTM4BP1-201ENST00000447781 690 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 LINC00533-201ENST00000456103 537 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 AC093627.1-201ENST00000465755 877 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 MBNL1-213ENST00000465907 945 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 RN7SL791P-201ENST00000467868 295 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 NDUFB2-215ENST00000482954 544 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 RN7SL314P-201ENST00000490735 292 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 GBA3-201ENST00000503442 1232 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 RPL27A-211ENST00000532359 406 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 AC087257.2-201ENST00000538759 928 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 ORMDL2-203ENST00000548974 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 OR4N2-203ENST00000557677 1008 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 RN7SL42P-201ENST00000579786 294 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 NDUFA3P1-201ENST00000588007 252 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 AC015802.4-202ENST00000591967 474 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 AC019080.4-201ENST00000606200 564 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 AL354733.2-202ENST00000615485 742 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 EAPP-205ENST00000618169 1237 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 AC079949.2-201ENST00000617117 2933 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
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