Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 FMO10P-201ENST00000455032 1493 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AC103760.1-201ENST00000521326 1486 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 CACNA1D-219ENST00000636938 6868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 GOSR2-238ENST00000640495 3395 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 IL31RA-206ENST00000447346 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 STAU2-226ENST00000524104 2173 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 CSTF2T-201ENST00000331173 4105 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 SUPT20H-205ENST00000464744 2625 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AC104083.1-201ENST00000569449 2615 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AIM2-202ENST00000368130 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 CADPS-220ENST00000613879 1804 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AL034397.3-202ENST00000621933 1815 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 ZNF793-208ENST00000588578 4549 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 METTL5-202ENST00000308099 629 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 CPSF4L-201ENST00000344935 647 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 FAM177B-201ENST00000360827 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AURKA-203ENST00000371356 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 MIR614-201ENST00000385082 90 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 MIR654-201ENST00000385199 81 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 DAZAP2-202ENST00000425012 1117 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 OR10G8-201ENST00000431524 1045 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 CDH13-203ENST00000431540 831 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AL157414.2-201ENST00000442780 377 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 LINC01706-201ENST00000455299 748 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 ABRACL-202ENST00000461027 456 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 RN7SL496P-201ENST00000470372 290 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AC105910.1-201ENST00000482585 483 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 CFI-204ENST00000510800 667 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AC020980.1-201ENST00000513041 458 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 IGKV3D-31-201ENST00000519131 281 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 CEP57L1-214ENST00000521277 3832 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 LINC02365-203ENST00000522554 802 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AAMDC-203ENST00000525034 511 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 PRR13-205ENST00000549068 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 GSTZ1-216ENST00000556627 919 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AC008870.2-201ENST00000568262 1024 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 NPM1P45-201ENST00000583151 559 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 FXYD1-205ENST00000588607 619 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AC073539.3-201ENST00000601905 386 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AL391807.1-201ENST00000603261 712 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 RN7SL840P-201ENST00000606883 284 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AC016999.2-201ENST00000614692 556 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 LINC01125-248ENST00000627284 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 Z83818.2-201ENST00000635331 433 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AC007848.1-201ENST00000538430 1405 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 WDR87-202ENST00000447313 9009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 MAPK10-347ENST00000641762 2856 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 HINFP-201ENST00000350777 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 HDAC2-AS2-208ENST00000519104 2016 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 NBPF25P-201ENST00000606775 2019 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 B3GALT5-202ENST00000380618 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 ZNF577-201ENST00000301399 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 MECOM-208ENST00000468789 3691 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AL109810.2-201ENST00000425559 1348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AL161756.1-201ENST00000555861 1751 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 CREM-212ENST00000374728 1933 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 MAPK10-296ENST00000641283 2826 ntAPPRIS P2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 NUP214-208ENST00000483497 3275 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AC104964.2-201ENST00000562242 4641 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 NLRP9-201ENST00000332836 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 ERVFRD-1-202ENST00000542862 3184 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 ODF2-220ENST00000604420 3030 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 TEX14-201ENST00000240361 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 GCNA-202ENST00000373696 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AC016027.2-201ENST00000441167 2493 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 GSTCD-201ENST00000360505 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 LDHA-201ENST00000227157 1887 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AC008937.3-201ENST00000606813 1700 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 ZNF19-210ENST00000567225 2838 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 KAT6B-205ENST00000372725 6944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 UBE2U-206ENST00000611228 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 DHX35-201ENST00000252011 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
ATG4DQ86TL0 AC245177.1-201ENST00000375625 2369 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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