Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073911.1-201ENST00000592296 504 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR205HG-210ENST00000603283 455 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008385.1-201ENST00000604421 355 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUSP22-216ENST00000605863 551 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL021807.1-201ENST00000607175 565 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL354872.2-201ENST00000607679 466 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL596094.1-201ENST00000608273 276 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR6745-201ENST00000612694 127 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EDRF1-AS1-210ENST00000613304 569 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010333.3-201ENST00000615100 402 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00922-203ENST00000569736 1760 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D32-201ENST00000275159 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGRMC2-202ENST00000394276 2858 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BRS3-201ENST00000370648 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ODF1-201ENST00000285402 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR13H1-201ENST00000338616 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP45-201ENST00000363509 304 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRSF10-206ENST00000374453 866 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEK10-203ENST00000383770 1257 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR623-201ENST00000384986 98 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GULP1-205ENST00000409805 983 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGLC6-201ENST00000410078 317 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC023141.10-201ENST00000415634 200 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL021707.2-202ENST00000422408 1080 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPPA-AS1-202ENST00000446542 1032 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RFC3P1-201ENST00000454568 682 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01789-202ENST00000455614 491 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL357874.2-201ENST00000457044 679 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL121721.1-201ENST00000460400 568 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFB2-215ENST00000482954 544 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL211P-201ENST00000485246 276 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL635P-201ENST00000492123 296 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01098-201ENST00000507870 1034 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR10J2P-201ENST00000514684 961 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC139783.1-201ENST00000515618 681 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00967-202ENST00000517725 259 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL10P9-201ENST00000522551 645 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP003555.2-201ENST00000528507 655 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FLT1-205ENST00000543394 1275 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073571.1-201ENST00000549103 475 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02373-201ENST00000549261 423 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM30C-201ENST00000561158 410 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCTD2-206ENST00000581589 993 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF793-AS1-205ENST00000589025 560 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Z98949.1-208ENST00000597614 816 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRMT112P7-201ENST00000603133 367 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL022238.3-201ENST00000609279 443 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL589743.4-201ENST00000610763 586 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FLT1-208ENST00000617835 434 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FTH1-212ENST00000620041 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012653.2-201ENST00000621880 420 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CASC23-201ENST00000534076 1563 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGSF6-201ENST00000268389 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPK10-379ENST00000642013 1385 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEMP2-202ENST00000409150 6168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms