Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 C4BPA-201ENST00000367070 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 YES1-201ENST00000314574 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 ADAMTS9-201ENST00000295903 7060 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 LINC00689-203ENST00000438049 3946 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC8.13□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 DEFB119-201ENST00000339144 484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
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HOXD10P28358 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 AL139806.1-201ENST00000403057 1002 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
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HOXD10P28358 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 AC009743.1-201ENST00000415774 610 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
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HOXD10P28358 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
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HOXD10P28358 AC108688.1-201ENST00000485817 713 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
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HOXD10P28358 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
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HOXD10P28358 AC015908.3-202ENST00000579367 457 ntTSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
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HOXD10P28358 LINC02028-206ENST00000593326 810 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 AC098590.2-201ENST00000614787 281 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 RPSAP68-201ENST00000625020 438 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 TCL6-201ENST00000352367 3398 ntTSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 CDC7-203ENST00000428239 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 CIITA-201ENST00000324288 11952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 TLN2-209ENST00000561311 11880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 ZNF69-202ENST00000429654 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
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HOXD10P28358 CTD-2201I18.1-202ENST00000514042 2705 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 SLC22A9-201ENST00000279178 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
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HOXD10P28358 RAD51AP2-201ENST00000399080 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 LINC01358-211ENST00000635571 1687 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
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HOXD10P28358 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
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HOXD10P28358 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
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HOXD10P28358 AL445430.2-201ENST00000423149 686 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 KCND3-AS1-202ENST00000427471 583 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 AC096677.2-201ENST00000430471 598 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
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HOXD10P28358 AC078785.2-201ENST00000462010 1253 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 RN7SL390P-201ENST00000470634 284 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 AC022126.1-201ENST00000502995 593 ntTSL 4 BASIC8.12□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 SCARNA6-201ENST00000515982 265 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 IGLVI-42-201ENST00000522485 381 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 LINC02413-201ENST00000549914 723 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 HNRNPA1P71-201ENST00000559135 950 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 HNF4A-AS1-202ENST00000609152 413 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 SUPT7L-202ENST00000404798 4114 ntTSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 PDE4DIP-246ENST00000618462 8150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
HOXD10P28358 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
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