Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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ARL2-SNX15V9GYD0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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ARL2-SNX15V9GYD0 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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ARL2-SNX15V9GYD0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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ARL2-SNX15V9GYD0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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ARL2-SNX15V9GYD0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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ARL2-SNX15V9GYD0 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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ARL2-SNX15V9GYD0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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