Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
U3KQE9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
U3KQE9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
U3KQE9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
U3KQE9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
U3KQE9 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
U3KQE9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
U3KQE9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
U3KQE9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
U3KQE9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
U3KQE9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
U3KQE9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
U3KQE9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
U3KQE9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
U3KQE9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
U3KQE9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
U3KQE9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
U3KQE9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
U3KQE9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
U3KQE9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
U3KQE9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
U3KQE9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
U3KQE9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
U3KQE9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
U3KQE9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
U3KQE9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
U3KQE9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
U3KQE9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
U3KQE9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
U3KQE9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
U3KQE9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
U3KQE9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
U3KQE9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
U3KQE9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
U3KQE9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
U3KQE9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
U3KQE9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
U3KQE9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
U3KQE9 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
U3KQE9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
U3KQE9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
U3KQE9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
U3KQE9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
U3KQE9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
U3KQE9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
U3KQE9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
U3KQE9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
U3KQE9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
U3KQE9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
U3KQE9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
U3KQE9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
U3KQE9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
U3KQE9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
U3KQE9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
U3KQE9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
U3KQE9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
U3KQE9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
U3KQE9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
U3KQE9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
U3KQE9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
U3KQE9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
U3KQE9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
U3KQE9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
U3KQE9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
U3KQE9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
U3KQE9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
U3KQE9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
U3KQE9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
U3KQE9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
U3KQE9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
U3KQE9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
U3KQE9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
U3KQE9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
U3KQE9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
U3KQE9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
U3KQE9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
U3KQE9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
U3KQE9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
U3KQE9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
U3KQE9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
U3KQE9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
U3KQE9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
U3KQE9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
U3KQE9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
U3KQE9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
U3KQE9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
U3KQE9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
U3KQE9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
U3KQE9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
U3KQE9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
U3KQE9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
U3KQE9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
U3KQE9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
U3KQE9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
U3KQE9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
U3KQE9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
U3KQE9 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
U3KQE9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
U3KQE9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
U3KQE9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms