Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CAPN6Q9Y6Q1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAPN6Q9Y6Q1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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