Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F8

CDY1, Testis-specific chromodomain protein Y 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDY1Q9Y6F8 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDY1Q9Y6F8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDY1Q9Y6F8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
CDY1Q9Y6F8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDY1Q9Y6F8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDY1Q9Y6F8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDY1Q9Y6F8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDY1Q9Y6F8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDY1Q9Y6F8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDY1Q9Y6F8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDY1Q9Y6F8 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDY1Q9Y6F8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDY1Q9Y6F8 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDY1Q9Y6F8 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDY1Q9Y6F8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDY1Q9Y6F8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDY1Q9Y6F8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDY1Q9Y6F8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CDY1Q9Y6F8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDY1Q9Y6F8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDY1Q9Y6F8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDY1Q9Y6F8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDY1Q9Y6F8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDY1Q9Y6F8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CDY1Q9Y6F8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDY1Q9Y6F8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms