Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX9Q9Y5X1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX9Q9Y5X1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms