Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF3C3Q9Y5Q9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms