Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L4

TIMM13, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM13Q9Y5L4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TIMM13Q9Y5L4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TIMM13Q9Y5L4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TIMM13Q9Y5L4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMM13Q9Y5L4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMM13Q9Y5L4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMM13Q9Y5L4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMM13Q9Y5L4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMM13Q9Y5L4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms