Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF330Q9Y3S2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF330Q9Y3S2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF330Q9Y3S2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF330Q9Y3S2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF330Q9Y3S2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF330Q9Y3S2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF330Q9Y3S2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF330Q9Y3S2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF330Q9Y3S2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF330Q9Y3S2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF330Q9Y3S2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF330Q9Y3S2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF330Q9Y3S2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF330Q9Y3S2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF330Q9Y3S2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF330Q9Y3S2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF330Q9Y3S2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF330Q9Y3S2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF330Q9Y3S2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF330Q9Y3S2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF330Q9Y3S2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF330Q9Y3S2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF330Q9Y3S2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF330Q9Y3S2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF330Q9Y3S2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF330Q9Y3S2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF330Q9Y3S2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF330Q9Y3S2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
ZNF330Q9Y3S2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF330Q9Y3S2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms