Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2N7

HIF3A, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF3AQ9Y2N7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIF3AQ9Y2N7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIF3AQ9Y2N7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms