Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

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Length 914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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USP20Q9Y2K6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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USP20Q9Y2K6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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USP20Q9Y2K6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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USP20Q9Y2K6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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USP20Q9Y2K6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP20Q9Y2K6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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