Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHKBQ9Y259 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms