Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOD1Q9Y239 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms