Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC3Q9UQE7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms