Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
TRAK1Q9UPV9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms